ncbi怎么用?
首先打開ncbi主頁
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
在搜索框左邊的下拉菜單選擇"Gene",并輸入要找的基因名稱(最好是正式名稱/縮寫或者常用名稱),例如想找人的超氧化物歧化酶1的基因,就輸入Superoxide dismuta 1或者sod1,然后點"Search",在結果頁面里選擇智人[Homo sapiens]的對應結果即可進入超氧化物歧化酶1的基因報告頁面(為了減少多余的結果,也可以把human/mou/rat之類的物種名加入關鍵詞,用拉丁名homo/mus/rattus也可以)。
在基因報告頁面里具體的基因組/mRNA/蛋白的信息可以將鼠標移動到基因圖示的基因名上面,顯示的下拉菜單里按第三個按鈕,向下箭頭,顯示更多信息里有相關鏈接;另外也可以通過頁面中間部分的"NCBI reference quences"找到對應的鏈接。
呃……看不懂英文就沒法幫你了,找個詞典吧!
NCBI主頁中arch中的nucleotide和gene有何區別
對于Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 2 (BCL2)的nucleotide和gene的信息分別如下:
nucleotide:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=nucleotide&val=4557354
gene:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=Retrieve&dopt=Graphics&list_uids=596
nucleotide主要關注堿基序列,里有個FASTA格式的序列可以下載,gene里主要是對這個基因進行詳細描述,涉及在基因組的位置,轉錄、翻譯等。詳細可以自己看看區別。
ncbi怎么用
ncbi使用教程
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2016-11-04 19054人看過
NCBI (National Center for Biotechnology Information)是指美國國立生物技術信息中心。理解自然無聲但精妙的關于生命細胞的語言是現代分子生物學的要求。通過只有四個字母來代表DNA化學亞基的字母表,出現了生命過程的語法,其最復雜形式就是人類。闡明和使用這些字母來組成新的“單詞和短語”是分子生物學領域的中心焦點。數目巨大的分子數據和這些數據的隱秘而精細的模式使得計算機化的數據庫和分析方法成為絕對的必須。挑戰在于發現新的手段去處理這些數據的容量和復雜性,并且為研究人員提供更好的便利來獲得分析和計算的工具,以便推動對我們遺傳之物和其在健康和疾病中角色的理解。在生物學研究中,NCBI提供了大量的生物信息分析工具以及文獻。所以學號檢索方法是進入新生物學領域的必備技能。Blast工具、PubMed文獻數據庫等。
工具/原料
瀏覽器 NCBI網址
方法/步驟
1/9 分步閱讀
首先進入NCBI主頁。
Map view演示,主要是找到相關基因在染色體上的位置,以人類IL-6基因為例。
點擊Map View
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選擇物種,點擊Go;
設置filter,過濾信息;
點擊Genes q查詢序列
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最后進入序列下載頁面,可以直接下載。可以選擇多種格式,一般選擇fasta。
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通過clone查詢相關基因的cDNA序列
選擇clone數據庫,arch基因描述。
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對基因的蛋白質序列和mRNA查詢。
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也可對序列進行查詢。基因組展示。
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也可以查詢序列信息。
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查詢已知引物,通過probe數據庫搜索。
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同源性比對blast。有多種比對方式。DNA,RNA,Protein等比對模式,排列越高表示同源性越強。也可以進行引物比對。
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注意事項
簡單演示仍需深入了解
21世紀是生物科學的世紀
軟件 NCBI
編輯于2016-11-04,內容僅供參考并受版權保護
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bsci認證機構哪家好?
如何在NCBI里得到序列
一、
進入NCBI主頁:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
在arch后面選擇Gene,在for后面填寫需要查找的基因的名字。點擊“Go”
出現了很多基因序列,在每個序列的右邊還有“Order
cDNA
clone”
的鏈接,這些序列中有些序列是跟你的目的基因同名的,有些是別名(Other
Alias)與你的目的基因一致,根據每個序列的介紹認真選擇你的目的基因。
二、查找cDNA、mRNA和蛋白序列
1.
查找cDNA序列
①
點擊Order
cDNA
clone,
②
點擊Clone
Sequence后面的鏈接即可得到cDNA序列。
NCBI是什么?主要是做什么?
NCBI是National Center for Biotechnology Information的縮寫,指美國國家生物技術信息中心,建立于1988年。
NCBI的初衷是為了給分子生物學家提供一個信息儲存和處理的系統。除了建有GenBank核酸序列數據庫(該數據庫的數據資源來自全球幾大DNA數據庫,其中包括日本DNA數據庫DDBJ、歐洲分子生物學實驗室數據庫EMBL以及其它幾個知名科研機構)之外,NCBI還可以提供眾多功能強大的數據檢索與分析工具。
擴展資料:
NCBI提供的資源有Entrez、Entrez Programming Utilities、My NCBI、PubMed、PubMed Central、Entrez Gene、NCBI Taxonomy Browr、BLAST、BLAST Link (BLink)、Electronic PCR等共計36種功能,而且都可以在NCBI的主頁www.ncbi.nlm.nih.gov上找到相應鏈接,其中多半是由BLAST功能發展而來的。
已故參議員克勞德·佩珀認識到計算機化信息處理方法對于進行生物醫學研究的重要性以及贊助立法,該立法于1988年11月4日成立了國家生物技術信息中心(NCBI),作為國家醫學圖書館的一個部門(NLM) )在美國國立衛生研究院(NIH)。
參考資料來源:
百度百科-NCBI