
生物信息學(xué)China Journal of Bioinformatics 專論與綜述
苯丙氨酸代謝途徑關(guān)鍵酶:PAL、C4H、4CL研究新進(jìn)展
李莉,趙越 ,馬君蘭
(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,哈爾濱150030)
摘要:主要闡述了苯丙氨酸代謝途徑tz-種關(guān)鍵酶:苯丙氨酸解氨酶(PAL)、肉桂酸4一羥基化酶(C4H)、4一香豆酸輔酶A連
接酶(4CL)的研究進(jìn)展,希望能為研究植物次生代謝途徑的研究工作者提供一些幫助。
關(guān)鍵詞:次生代謝:苯丙氨酸解氨酶(PAL);肉桂酸4一羥基化酶(C4H);4一香豆酸輔酶A連接酶(4cL)
中圖分類號:Q591 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:1672—5565(200r7)一04—187—03
Recent progress on key enzymes:PAL、C4H、4CL
of phenylalanine metabolism pathway
U li,ZHAO Yue ,MA Jun—lan
(School of如 science,Northeast w £ 疵 ,Harbin150030,Otina)
:Phenylalanine metaho ̄sm pathway is one ofthe most important pathway of plant secc metaho ̄sm.That pathway be valued by
nlol ̄and nlol ̄pemons becau¥e its outcome have special biology function(such a8 isoflavone etc.). n1is text mainly elahorated¥onle recent
progress on three key em nes ofphenylalanine metabolism pathway:PAL、C4H、4 CL.We hope that our study Can slve the pemons who work-
ing on this project¥Ome helps.
Key Words:se(mdary船tab0lisn1;Ph唧心anil1e antmnialyas(P );Ciunmrmte4一hydrc ase(C4H);4-Carom-ate: ̄mzyme A llgase(4 )
植物的代謝分為初級代謝和次級代謝。植物的次級代謝 酸和氨生成L一苯丙氨酸(L--phen ̄alanine)。利用PAL這
有多條途徑,苯丙氨酸代謝途徑,從碳流的角度來看,是植物最 種逆向催化特性生產(chǎn)卜苯丙氨酸,成為當(dāng)前生物化工領(lǐng)域
重要的次生代謝途徑之一。在一個(gè)細(xì)胞中,有20%以上的代謝 研究與開發(fā)的熱點(diǎn)。
會通過這條途徑,該代謝途徑的重要性在于:一切含苯丙烷骨架 1.1.2 PAL的基本特性
的物質(zhì)都是由這一途徑直接或間接生成。莽草酸途徑產(chǎn)生的類P 己從許多植物組織中純化和分離,不同來源的PAL結(jié)
黃酮、木質(zhì)素等次生物質(zhì)在植物抗逆境、抗病害上有非常重要的 構(gòu)、分子量等均不盡相同,但總的來說其分子量約為240
作用。近年來,越來越多的科學(xué)工作者把眼光投放到苯丙氨酸 330kD,可解離為55 85kD的亞基,全酶為4個(gè)相同亞基構(gòu)成的
代謝途徑關(guān)鍵酶的研究,因?yàn)檎{(diào)節(jié)這些酶的表達(dá)活性,有效地調(diào) 四聚體。不同植物中PAL的氨基酸組成不同,如水稻中的PAL
節(jié)與之相應(yīng)的次級代謝產(chǎn)物的生物合成,培育出適合人類生產(chǎn) 酸性成分少于/J、麥、玉米、馬鈴薯,而中性成分高于以上三種植
生活需要的植物新品種,如低木質(zhì)素含量的造紙?jiān)蠘浞N、高異 物。P虬沒有單一的Km值,一般在10~ 10 之間。PAL的活
黃酮含量的大豆品種等。 性中心部位具有脫氫丙氨?;挠H電中心。
1.1.3 PAL基因的結(jié)構(gòu)
1 PAL、CAH、4CL研究的新進(jìn)展
1.1 苯丙氨酸解氨酶( a1aI】il1e舭蚴衄ialyas,PAL)
1.1.1 PAL的作用
在次生代謝酶類中,PAL是研究較多、較早(Koukol,
1961)、最詳盡的酶,它使植物的次生代謝與初生代謝聯(lián)系起
來。該酶行使功能時(shí)不需要輔助因子參與,最適pH8.8(個(gè)
別大于9),它催化苯丙氨酸途徑中的第一步反應(yīng),通過一個(gè)
非氧化脫氨基作用把苯丙氨酸轉(zhuǎn)變成肉桂酸(cinnamln acid)
和氨;當(dāng)過量的氨存在,且pH為10—10.5時(shí),PAL催化肉桂
多數(shù)被子植物中,PAL亞基通常由小型基因家族編碼
(一般2—5個(gè)成員),這些基因家族又可分成2或3個(gè)亞族。
該酶在所有的植物中都有。
1.1.4 PAL基因的表達(dá)調(diào)控
1.1.4.1內(nèi)部調(diào)節(jié)
首先,發(fā)育調(diào)節(jié),PAL酶活性隨植物生長發(fā)育過程推進(jìn)
而不斷地變化。其次,PAL鈍化因子和調(diào)節(jié)因子的調(diào)控,植
物體內(nèi)有一種PAL的內(nèi)源性抑制物質(zhì)(PAL—inhibitor,PAL—
I)參與了PAL活性的調(diào)節(jié)。最后,末端產(chǎn)物調(diào)節(jié),PAL的抑
制劑有許多種類,包括肉桂酸、對一香豆酸、以及某些氨基酸
收稿日期:2005—12—16;修回13期:2006—03—16
基金項(xiàng)目:黑龍江省教育廳資助課題(編號為10551024)
作者簡介:李莉(1978一),女,在讀碩士,研究方向:生物化學(xué)與分子生物學(xué).E—mall:lily.mu695@sohu.(ggn
*通訊作者:趙越(197O一),女,碩士生導(dǎo)師。
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188 生 物 信 息 學(xué) 第5卷
如組氨酸、色氨酸等,另外不同來源的PAL對同一種類抑制
劑的敏感性不同。
1.1.4.2外部調(diào)節(jié)
PAL是一種誘導(dǎo)酶,可以受多種外界因素的誘導(dǎo)。各種
類型的低溫、機(jī)械損傷、光(白光、藍(lán)光、紅光、紫外光)、病原
菌感染、毒素處理和昆蟲取食都可以誘導(dǎo)PAL基因的表達(dá),
這種誘導(dǎo)是在轉(zhuǎn)錄水平上的誘導(dǎo),并具有組織特異性。生長
素(IAA)、激動素(BAP)和乙烯(乙烯利)也都可誘導(dǎo)植物PAL
基因的表達(dá),刺激效應(yīng)乙烯>IAA>BAP。也有研究表明,各
種因子對PAL的誘導(dǎo)存在著互作關(guān)系,如在切傷誘導(dǎo)甘薯
塊根切片PAL活性增高時(shí),L 、BAP、乙烯能使PAL的活性
進(jìn)一步增加;且BAP的效應(yīng)又可因被照光而增強(qiáng)。
另外,在苯丙烷代謝途徑中,PAL催化反應(yīng)曾被認(rèn)為是
限速步驟,因?yàn)橐恍┳C據(jù)表明,抑制該酶及其基因表達(dá)會引
起苯丙酸的積累(Camm and Towers,1973)。然而Anterola等
(Anterola et al,2002)對松樹懸浮細(xì)胞系的研究中發(fā)現(xiàn),隨著
培養(yǎng)基中苯丙酸濃度增高,會引起PAL,4CL等酶活性升高。
進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),在光照條件下大豆PAL表達(dá)量比黑暗條
件下高,隨著處理時(shí)間的延長,其mRNA的量和酶活性增加,
但是在次級代謝產(chǎn)物(如異黃酮)的積累水平上,這都表明在
這個(gè)過程中PAL可能為非限速酶。
1.2 CAH的研究進(jìn)展
1.2.1 CAH的作用
CAH是第一個(gè)被鑒定的植物P450單加氧酶(Russell D
W,1967,1971),也是第一個(gè)既被克隆、又確定了功能的植物
P450酶,與其他P450相比,CAH具有在植物的各組織中均具
有很高活性的特點(diǎn)(Fahrendorf et al,1993,Mizutani M et al,
1993,Teutsch H G et al,1993)。該酶行使功能需氧且依賴
NADPH,它催化苯丙氨酸途徑的第二步反應(yīng),同時(shí)是也該途
徑的第一個(gè)氧化反應(yīng),在肉桂酸的對位點(diǎn)上催化位置特異性
的羥化反應(yīng),將反式肉桂酸催化生成對一香豆酸。
1.2.2 CAH基因的結(jié)構(gòu)
動物中P450的結(jié)構(gòu)與表達(dá)已經(jīng)有較多的了解。然而植
物P450的功能及表達(dá)特征卻知道得不多。
目前至少有20種CAH基因從植物中分離。同PAL基因
一樣,CAH基因拷貝數(shù)在不同植物中也是不同的。苜蓿有兩
個(gè)CAH基因,豌豆(Hsumsafivum)只有一個(gè)拷貝,綠豆和長春
花(Catharanthusroseus)的CAH是由多個(gè)拷貝組成的一個(gè)小的
基因家族。這些基因編碼的氨基酸序列同源性普遍較高約
85%。但其中來自玉米和法國菜豆的兩個(gè)序列例外。同源性
僅達(dá)60%(Potter et al,1995;Nedelkina et al,1999)。另外,對已
發(fā)表的CAH啟動子序列進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)啟動子大約1.1kb
(Kawai et al,1996)
1.2.3 CAH基因的表達(dá)調(diào)控
CAH的表達(dá)與植物的木質(zhì)化進(jìn)程密切相關(guān)(Chapple。
1998)。歐芹中CAH表達(dá)模式研究結(jié)果顯示,該酶在維管束
發(fā)達(dá)的花梗中表達(dá)豐富,在幼葉和老葉中不表達(dá)(Koopmann
et al,1999);擬南芥中CAH基因于正在木質(zhì)化的細(xì)胞中表達(dá)
最強(qiáng)(Bell—Lelong et al,1997)。
人們在對CAH功能的研究中發(fā)現(xiàn),在植物的生長發(fā)育
過程中以及各種外界因子,如激發(fā)子、真菌感染、機(jī)械損傷及
化學(xué)誘導(dǎo)子等刺激下,其編碼基因mRNA積累水平的變化趨
勢與PAL趨于一致。
1.3 4CL的研究進(jìn)展
1.3.1 4CL的作用
4CL作用于苯丙酸途徑中最后一步反應(yīng),催化各種羥基
肉桂酸生成相應(yīng)的硫酯,這些硫酯處于苯丙酸代謝途徑和各
種末端產(chǎn)物特異合成途徑的分支點(diǎn)。以前認(rèn)為4CL主要以
香豆酸、咖啡酸和阿魏酸為催化底物,不以芥子酸為底物
(Ehlting et al,1999;Hu et al,1999;Allina et al,1998),由此推測
s木質(zhì)素的合成途徑可能并不經(jīng)過芥子酸(魏建華和宋艷
茹,2001)。然而Lindermayr等(Lindermayr et al,2002)從大豆
中分離了一種4CL同工酶,它芥子酸為底物催化分成芥子酞
一輔酶A。另外Yamauehi等(Yamauehi et al,2003)以四種植
物為研究對象,進(jìn)行放射性同位素示蹤實(shí)驗(yàn),結(jié)果表明洋槐
和夾竹桃中的芥子酸可最終生成芥子醇,而在擬南芥和木蘭
中卻不能。這一結(jié)果揭示出被子植物中4CL催化底物特異
性因植物種類而異。
1.3.2 4CL基因的結(jié)構(gòu)
Voo等(1995)從火炬松木質(zhì)部中克隆出了一個(gè)4CI.c.
DNA,編碼64kI)多肽;l-Iaufe等從荷蘭芹中分離出的4CL1基
因及舊動子,可在植物莖中特異表達(dá),現(xiàn)已將4CL基因從大
豆、松樹、歐芹、楊樹等幾種植物中克隆出來,對所有已知植
物4CL的系統(tǒng)樹分析表明,4CL1屬于一個(gè)簇,而4CL2則屬
于另外一個(gè)簇。
1.3.3 4CL同功酶的研究
4CL通常以基因家族形式存在,其同工酶具有不同的底
物特異性和時(shí)空表達(dá)特性,具有各自的生理功能。在顫楊
中,Pt4CL1參與木質(zhì)素的生物合成途徑,Pt4CL2則參與類黃
酮的形成(Hu et al,1998);在大豆中存在四個(gè)同工酶,
Gm4CL1和Gm4CL2參與植物的生長和發(fā)育,Gm4CI.3和
Gm4CIA則對外界環(huán)境因子產(chǎn)生響應(yīng)(Lindermayr et al,2002)。
2應(yīng)用前景及分子生物學(xué)展望
2.1應(yīng)用前景
由于生產(chǎn)和保健的需要,植物抗病育種,生物活性成分
成為現(xiàn)代生物技術(shù)的焦點(diǎn)之一。開展對PAL、C4H、4CL酶基
因作用機(jī)制,表在部位和時(shí)空表達(dá)模式的研究,將再利于我
們進(jìn)一步研究它們的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)理、改變表達(dá)活性。一
方面,提高植物抗性,既可減少生產(chǎn)上經(jīng)濟(jì)損失,又可減少農(nóng)
藥等對人類健康以及生態(tài)環(huán)境的損害;另一方面,富集特定
目的次生代謝產(chǎn)物,經(jīng)過苯丙烷代謝途徑的許多次生代謝產(chǎn)
物是天然的、對許多重大疾病有獨(dú)特療效的活性成分。在醫(yī)
療保健具有不可替代的作用(如異黃酮等)。另外,可通過調(diào)
控酚類物質(zhì)代謝影響色澤發(fā)育,因此有理由相信,利用分子
生物學(xué)技術(shù)能大規(guī)模的改變花及果實(shí)的色澤,從而改良植物
的品質(zhì),提高經(jīng)濟(jì)效宜。
2.2分子生物學(xué)展望
隨著分子生物學(xué)尤其是基因測序技術(shù)的不斷發(fā)展,更多
不同來源的P^JL、CAH、4CL基因序列將被克隆和測序,通過
分別與已知基因序列的比較分析,能夠從分子水平上揭示它
們的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),從而為更好的改造這些基因,改變它們的表
達(dá)活性提供更多的基礎(chǔ)資料。對于涉及多個(gè)基因表達(dá)的植
物次生代謝,同時(shí)增強(qiáng)多個(gè)基因的協(xié)同表達(dá)是提高次生代謝
物產(chǎn)量所必需的。人們在對這三種酶編碼基因的啟動于序
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第4期 李 莉,等:苯丙氨酸代謝途徑關(guān)鍵酶:PAL、C4H、4CL研究新進(jìn)展 189
列進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),它們的啟動子序列中具有一些共同的順式
作用元件(Logemann et al,1995;Bell—lelong et al,1997;Mizutani
et al,1997),這為實(shí)現(xiàn)增強(qiáng)多個(gè)基因的協(xié)同表達(dá)提供了可
行性。
總之,進(jìn)一步開展對PAL、CAH、4CL酶基因作用機(jī)制、表
達(dá)部位和時(shí)空表達(dá)模式的研究,將利于我們進(jìn)一步研究它們
的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)理,并用之轉(zhuǎn)化植物使之按照人們的意愿
在轉(zhuǎn)基因植物中大量持久地表達(dá),從而增強(qiáng)植物對病害的廣
譜持久抗性,提高特定次生代謝產(chǎn)物(比如大豆異黃酮)的含
量等,更好地為人類服務(wù),這也將是今后研究的焦點(diǎn)之一。
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