
廣西植物Guihaia 24
(
4
)
:367-372 2004年7月
硝酸還原酶活性的調(diào)節(jié)及可能機制的研究進展
張 濤1,陳 云2,謝 虹2,梁建生23
(
1.揚州大學農(nóng)學院,江蘇揚州225009;2.揚州大學生物科學與技術學院,江蘇揚州225009
)
摘 要:氮素是農(nóng)業(yè)研究的重點,硝酸還原酶是氮代謝中的一個關鍵酶。有關硝酸還原酶的研究一直是植物
生理生化研究的重點。該文就近年來有關硝酸還原酶活性調(diào)節(jié)的可能機制的研究進展作了簡要的綜述。
關鍵詞:硝酸還原酶;蛋白激酶;磷酸酯酶;142323蛋白
中圖分類號:Q945 文獻標識碼:A 文章編號:100023142
(
2004
)
收稿日期:2003203224 修訂日期:2003209224
作者簡介:張濤(
19792)
,男,山東威海人,碩士研究生、植物學專業(yè)。3為通訊作者
Therearchprogressoftheregulationofnitrate
reductaactivityandthepossiblemechanism
ZHANGTao1,CHENYun2,XIEHong2,
LIANGJian2sheng23
(
11CollegeofAgriculture,YangzhouUniversity,Yangzhou225009,China;21CollegeofBiological
ScienceandTechnolog,YangzhouUniversity,Yangzhou225009,China
)
Abstract:dyofnitratereducta,whichisakeyenzyme
inthemetabolismofnitrogen,ticlesummarizestherearchprogressofthe
regulationofnitratereductaactivityandthepossiblemechanisminrecentyears.
Keywords:nitratereducta;proteinkina;phosphorylation;142323protein
硝酸還原酶(
nitratereducta,NR,EC.1.6.6.
1/2
)是氮代謝過程中的一個重要的調(diào)節(jié)酶和限速
酶。在植物的根和葉中都有該酶的存在,它是一種
可溶性的鉬黃素蛋白,由黃素腺嘌呤二核苷酸
(
FAD
)、細胞色素b
557
和鉬等輔助因子組成。研究
表明,NR催化的反應不是唯一的,它能夠催化2個
電子從NAD
(
P
)
H+H+至NO
3
-,使后者轉(zhuǎn)變?yōu)?/p>
NO
2
-;還可以催化一個電子從NAD
(
P
)
H+H+至
NO
2
-生成NO
(
Yamasaki等,1999
)
;還有報道NR
能催化1個電子從NAD
(
P
)
H+H+至O
2
生成超氧
自由基(圖1
)(
Barber和Kay,1996;Yamasaki和
Sakihama,2000
)。
在正常情況下,還原NO
3
-為NO
2
-的反應是硝
酸還原酶催化反應的主流,反應在細胞質(zhì)中進行。
NR催化NO
2
-生成NO的反應只占催化NO
3
-還
原能力的很小百分比(約1%
)
,盡管產(chǎn)生NO的量
很少,但其對植物的一些生理活動有著重要的調(diào)節(jié)
及影響,RadhikaDesilan等發(fā)現(xiàn),NR催化NO
2
-產(chǎn)
生的NO在ABA誘導氣孔關閉的過程中有重要的
作用,通過對ABA鈍感型等突變體的研究發(fā)現(xiàn),NR
催化的NO的生成是ABA誘導氣孔關閉所需的。
但是NO在其他生理活動中的作用機理尚不清楚
(
Kair和Huber,2001
)。
1 硝酸還原酶的組成
研究發(fā)現(xiàn),高等植物的NR似乎是由相同亞基
組成的二聚體,每個亞基含有3個輔助因子,即
FAD、血紅素(細胞色素b
557
)和鉬輔因子(
MoCo
)。
每個輔因子相當于一個氧化還原中心。MoCo是一
個取代的喋呤基(又稱鉬喋呤)
,含有由兩個硫配體
結(jié)合的鉬。用限制性內(nèi)切酶對菠菜NR進行酶切,
發(fā)現(xiàn)二聚體結(jié)構的分子具有75KDa含鉬的區(qū)域,
血紅素輔基與14KDa區(qū)域相聯(lián)系,而FAD輔基包
含在28KDa的區(qū)域,3個區(qū)域似乎通過鉸鏈區(qū)域
(
hinge
regions
)連接。通過對高等植物NR的克隆
和序列分析得知:MoCo結(jié)合區(qū)域位于蛋白質(zhì)N2末
端,血紅素結(jié)合區(qū)域位于蛋白質(zhì)的中心區(qū)域,FAD
結(jié)合區(qū)域位于蛋白質(zhì)的C2末端。后來得知,NR分
子中電子的傳遞途徑是NAD
(
P
)
H+H+→FAD→
細胞色素b
557
→鉬喋呤→硝酸鹽(宋松泉等,1993;
Ahmad和Abdin,1999
)。
在大多數(shù)高等植物中,NR以NADH為電子供
體,這種NR對NO
3
-有相對低的Km值。而在水
稻幼苗、大豆等植物中,NR可以從NADH+H+或
NADPH+H+得到電子,并且以NADPH+H+為電
子供體時活性較高。Ahmad等(
1999
)發(fā)現(xiàn)芥菜幼
苗期,當營養(yǎng)液中的NO
3
-濃度較低時,以NADH
為電子供體的NR催化占主導,隨著NO
3
-濃度的
升高,以NADPH為電子供體的NR催化占據(jù)了主
導作用。
2 硝酸還原酶活性調(diào)節(jié)機制
2.1硝酸還原酶的活性狀態(tài)
NR對環(huán)境條件十分敏感,光、NO
3
-含量、CO
2
濃度等均會影響其活性。例如菠菜由光下移至暗中
幾分鐘后,其葉片NR便明顯地失活,而NR蛋白的
合成或降解無法在如此短時間內(nèi)達到這樣的結(jié)果
(
Kair和Forster,1989
)。可以設想,植物體內(nèi)存在
一種機制,能快速準確地調(diào)控NR的活性以適應環(huán)
境條件的改變。這種改變可能只是NR蛋白自身的
改變,并沒有涉及到轉(zhuǎn)錄或翻譯水平。用凝膠柱層
析的方法除去粗酶液中的小分子化合物后,NR仍
可以保持相當?shù)幕钚?這說明該酶不是變構調(diào)節(jié)
(
allostericmodulation
)
,其活性的改變是由于NR蛋
白的修飾而實現(xiàn)的,由此推測最有可能的機制是蛋
白的氧化/還原或蛋白的磷酸化/去磷酸化,由于還
原劑二硫蘇糖醇(
DTT
)或氧化劑過氧化氫對NR的
活性影響不大(
Kair和Huber,1994
)
,因而得知
NR活性的調(diào)節(jié)不是由蛋白的氧化/還原引起的。
通過32P標記技術,發(fā)現(xiàn)菠菜NR蛋白在Ser
543
可以
被磷酸化,并引起NR的失活。后來又發(fā)現(xiàn),磷酸化
不是NR失活唯一的原因,它還需要額外的蛋白的
參與(
Kair和Huber,2001
)
,這類蛋白即142323蛋
白家族。在有毫摩爾每升濃度級的游離Mg2+存在
的情況下,142323蛋白(
142323s
)與NR的磷酸化位
點結(jié)合,從而導致NR失活(
Aitken,1996;Moorhead
等,1999
)。所以推測細胞中NR可能存在3種狀
態(tài):①自由的NR
(具有酶活性)
;②被磷酸化的NR
(
pNR,具有酶活性)
;③142323s結(jié)合的磷酸化NR
(
pNR:142323s,無酶活性)(
Kair等,2002
)。以上
三種狀態(tài)的NR的比率是可變的,且主要是由環(huán)境
因素決定的,當外界條件例如光、NO
3
-、CO
2
等發(fā)生
改變時,三種NR活性狀態(tài)的比率會發(fā)生可逆而迅
速的變化,現(xiàn)在認為這是暗處理一段時間后,菠菜葉
片中NR快速地失活的主要原因。
2.1.1142323蛋白家族 142323s是起廣泛調(diào)節(jié)作用
的一類蛋白。最先發(fā)現(xiàn)142323s是存在于動物中的
含量豐富、酸性的、可溶性的腦蛋白,其分子量為25
~32kDa。但隨著植物領域的進一步研究,發(fā)現(xiàn)在
所有的已研究的真核生物器官中均有142323s家族
成員的存在,Ronquist等列出在48個品種中有
153種該類蛋白。142323s有著高度的序列一致性,
即使在不同的品種內(nèi),它也可以對靶蛋白起作用。
142323s一般是通過與目標蛋白結(jié)合而起作用的,目
標蛋白通常會有磷酸化位點,142323s可以識別該位
863
廣 西 植 物 24卷
點,結(jié)合后起到調(diào)節(jié)的作用。Muslin等發(fā)現(xiàn)142323s
識別的位點通常有RSXpSXP序列(
X表示任意一
種氨基酸,pS表示磷酸化的Ser。)(
Muslin等,
1996
)
,當然142323s還可以與其他的磷酸化片斷或
非磷酸化片斷結(jié)合(
Masters等,1999
)。
在高等植物中,142323s可以調(diào)節(jié)眾多的生物代
謝過程,甚至在擬南芥中,由于142323s的這種廣泛
調(diào)節(jié)作用,又稱之為廣泛調(diào)節(jié)因子(
GRFs
)(
Rooney
和Ferl,1995
)。142323s能夠調(diào)節(jié)蛋白激酶C的活
化(
Toker等,1990
)
,通過植物質(zhì)膜H+2ATP酶調(diào)節(jié)
質(zhì)子泵(
Oecking等,1994
)
,調(diào)節(jié)植物代謝過程中的
關鍵酶(
Bachmann等,1996;Toror等,1998
)
,如在
氮代謝過程中,它可以改變NR和谷氨酰胺合成酶
等的活性狀態(tài)。
2.2硝酸還原酶活性狀態(tài)轉(zhuǎn)換的可能機制
有研究表明,NR可以在MoCo區(qū)域與血紅素
區(qū)域之間的鉸鏈區(qū)域被磷酸化,從而產(chǎn)生了一個可
與142323s結(jié)合的位點(
Bachmann等,1996
)。當有
毫摩爾每升濃度級的游離Mg2+存在時,142323s結(jié)
合到pNR上,使之失去活性。當沒有Mg2+存在時
(加入EDTA
)
,所有的NR處于活性狀態(tài)(
100%
)
,
當存在Mg2+時,NR活性為實際活性狀態(tài)(
x%
)。
NR活性狀態(tài)的轉(zhuǎn)換可以表示為圖2
(
Kair和Hu2
ber,2001
)。
2.2.1硝酸還原酶的磷酸化與去磷酸化 用陰離子
交換色譜分析菠菜的葉片提取液,可以測得數(shù)個
NR激酶(
PK
)峰,這些激酶可以磷酸化NR的Ser
543
位,并產(chǎn)生142323s結(jié)合位點。一種激酶是SNF1相
關酶(
SnRK1
)(
Subden等,1999
)
,這種酶本身可能
被代謝物抑制。另外兩種激酶屬于CDPKs
(
Calci2
um2dependentproteinkinas
)。現(xiàn)在還不清楚
SNF1相關酶或CDPKs是如何磷酸化NR或如何通
過其它信號調(diào)控NR的,但暗中葉片細胞內(nèi)Ca2+濃
度伴隨NR磷酸化、失活的同時而升高的現(xiàn)象可能
提供一條研究線索(
Miller和Sanders,1987
)。
pNR的去磷酸化是由磷酸酯酶2A催化的
(
PP2A
)
,它主要存在于胞漿內(nèi),但現(xiàn)在對植物中該
酶的結(jié)構及組成所知不多,僅知道其作用于pNR的
活性也受代謝物的調(diào)節(jié)。另有研究發(fā)現(xiàn),去磷酸化
并非活化NR的唯一途徑(
Mackintosh和Meek,
2001
)
,一些小分子,包括磷酸鹽、EDTA和AMP也
能活化NR
(
Aguera等,1999;Kair等,1992
)。而
圖2 NR的活性狀態(tài)及參與分子
Fig.2 NRactivitystateandtherelevantmolecules
PK催化NR的磷酸化,PP催化NR的去磷酸化。NR的
磷酸化狀態(tài)并不失去活性,但由于NR的磷酸化,
使得142323s能夠在Mg2+存在的條件下與
pNR結(jié)合,最終導致NR的失活。
NRcanbephosphorylatedbyPKanddephosphorylated
eexistenceofMg2+,142323scan
stateofpNR:142323shasnoactivation.
142323s與pNR結(jié)合后會阻礙pNR的去磷酸化,因
為142323s結(jié)合后的pNR的去磷酸化比pNR的去
磷酸化速度更緩慢(
Bachmann等,1996
)。Bach2
mann等人認為142323s使NR的去磷酸化減緩的原
因是使NO
3
2
的還原減慢,從而光合作用能夠提供
NH
4
+轉(zhuǎn)化為氨基酸所需足夠的碳骨架。還有人認
為142323s與NR結(jié)合后會穩(wěn)定NR的磷酸化狀態(tài),
阻止去磷酸化。
蛋白激酶的作用與其底物ATP水平有關,缺氧
條件下,組織中ATP水平下降,NR被活化,這可能
963
4期 張 濤等:硝酸還原酶活性的調(diào)節(jié)及可能機制的研究進展
是NR磷酸酯酶的作用超過NR激酶的作用(
Glaab
和Kair,1993
)。總之,在一般情況下,蛋白激酶和
磷酸酯酶的共同作用使得NR和pNR處于動態(tài)的
平衡,該平衡會被外界因素快速地調(diào)節(jié)。
2.2.2142323蛋白與硝酸還原酶的結(jié)合 現(xiàn)在我們
已經(jīng)清楚142323s在植物及真菌等生物體中起重要
的調(diào)節(jié)作用(
Aitken,1996
)。天然存在的NR分子
與142323s結(jié)合的位點是在第一鉸鏈區(qū)域可被磷酸
化的Ser
543
附近的序列(
Bachmann等,1996
)。14232
3s與pNR結(jié)合后引起NR失活的原因可能是使
NR的空間結(jié)構發(fā)生改變,進而導致MoCo區(qū)域與
血紅素區(qū)域間的電子傳遞無法進行(
Kair和Hu2
ber,2001
)。Weiner和Kair
(
1999
)利用突變體的
研究發(fā)現(xiàn),每個NR分子可以與2個142323s結(jié)合,
于是推測NR分子上可能存在另外一個142323s結(jié)
合位點(
Pigaglio等,1999;Weiner和Kair,2001
)
,
142323s與該位點結(jié)合的作用可能是穩(wěn)定NR的磷
酸化狀態(tài),另外還有研究證明除了Ser
543
位點,NR
的N末端也參與了142323s的結(jié)合。
當有二價陽離子存在時,142323s與磷酸化片段
的連接會得到促進(
Athwal等,1998
)。Provan等發(fā)
現(xiàn),要想分離出142323s結(jié)合的煙草pNR,必須要有
游離Mg2+的存在(
Sugden等,1999
)
,這進一步證實
了只有毫摩爾每升濃度級的游離Mg2+時,142323s
才會與pNR結(jié)合并使之失活的說法。在光/暗轉(zhuǎn)換
的條件下,Mg2+的存在會明顯改變NR活性。
Kair等(
2001
)推測金屬陽離子在NR活性調(diào)節(jié)中
可能起以下幾個作用:
(
1
)蛋白激酶本身是一個Ca
離子依賴酶;
(
2
)蛋白激酶的底物是Mg2+2ATP;
(
3
)
金屬陽離子是使pNR2142323s復合體失活所必需
的。但至今仍不清楚金屬陽離子是在142323s與
pNR結(jié)合中所必需的,還是pNR2142323s復合體失
活中所需的,或者起到以上二者作用(
Weiner和
Kair,1999
)。
由上文所述,NR的三種活性狀態(tài)中只有14232
3s結(jié)合pNR態(tài)無活性,所以142323s的結(jié)合與否很
重要。有試驗證明,營養(yǎng)條件、激素均可能對14232
3s進行翻譯后調(diào)節(jié),從而改變142323s與pNR的結(jié)
合比例,進一步調(diào)節(jié)NR的活性(
Mackintosh和
Meek,2001
)。另外,142323s是一類起廣泛調(diào)節(jié)作
用的蛋白家族,pNR不是它們的唯一受體,細胞內(nèi)
142323s含量遠高過NR的量,二者要想結(jié)合,pNR
必須要和可與142323s結(jié)合的磷酸化片段競爭,該競
爭也在NR的活化/去活化過程中起一定的調(diào)節(jié)作
用(
Camoni等,1998
)。
在NR參與磷酸化失活的位點的研究中,早先
發(fā)現(xiàn)馬鈴薯NR的N2末端參與了該酶磷酸化失活
的過程。Pigaglio等(
1999
)發(fā)現(xiàn)NR蛋白的N2末端
氨基酸去除后,較野生型對熱更為敏感,但是相應的
對黑暗條件下的磷酸化去活不敏感,而且缺失N2末
端的突變體不會受光/暗交叉處理的影響。在菠菜
中,當?shù)鞍踪|(zhì)水解NR使之失去前45個氨基酸時,
NR活性不再因142323s的結(jié)合而失活盡管它仍會
被磷酸化。這表明,NR的N2末端區(qū)域在一定程度
上參與其磷酸化失活的過程。Provan等的研究結(jié)
果與Pigaglio有所不同,在有Mg2+和磷酸酯酶抑制
劑存在的條件下,NR與內(nèi)生142323s通過層析可以
共分離。NR活性的測定與蛋白質(zhì)雜交表明內(nèi)生
142323s可以與野生型NR和突變體NR共同分離。
突變體NR的電子傳遞在亞鐵血紅素結(jié)合區(qū)域被
Mg2+/142323s抑制,而在野生型NR中不存在這種
現(xiàn)象,這可能是142323s與野生型NR和突變體NR
的結(jié)合形式不同。而且認為NR的不穩(wěn)定性與鉬喋
呤所在的部位有關,N末端的56位氨基酸可能與鉬
喋呤的穩(wěn)定性有關(
Bachmann等,1996
)。
2.3蓖麻Ricinuscommunis中硝酸還原酶活性調(diào)節(jié)
就現(xiàn)研究的高等植物中,絕大部分NR活性的
調(diào)節(jié)是通過NR、磷酸化NR、142323s結(jié)合的磷酸化
NR三者之間的轉(zhuǎn)換而實現(xiàn)的,但也有例外,Ricinus
communis的葉片和根中的NR活性調(diào)節(jié)機制就與
其它高等植物不同。據(jù)Kandlbinder等(
2000
)的研
究,在pH7.6且有5~10mMMg2+存在的條件下,
Ricinus的NR活性極低,光下與暗中的差別也不
大,但在EDTA存在的條件下,最大NR活性是正
常的。但當調(diào)節(jié)pH低于7時,提取液中NR活性
快速提高,調(diào)節(jié)pH大于7.3時,NR活性又變得極
低。其原因可能是在不同pH值條件下,NR對
Mg2+的敏感度相差很大,在生理pH值下,Ricinus
對Mg2+較其它高等植物更敏感。
用免疫研究技術進一步研究蓖麻NR活性調(diào)節(jié)
的機制,發(fā)現(xiàn)其NR的Ser磷酸化位點和142323s結(jié)
合修飾是與其它植物相同的,所以關于RicinusNR
活性的調(diào)節(jié)機制仍然沒有明確的答案。只是推測
NR分子上存在重金屬離子結(jié)合位點,金屬離子如
Zn2+的結(jié)合會引起NR的失活(
Campbell,1999
)
,該
結(jié)合位點的序列可能會發(fā)生改變,使得Mg2+亦可
073
廣 西 植 物 24卷
與之結(jié)合,pH值的改變可能引起NR重金屬結(jié)合位
點序列發(fā)生改變,使得NR對Mg2+的敏感性提高,
從而調(diào)節(jié)酶的活化/失活。
3 硝酸還原酶的降解
NR的半衰期很短,僅為幾小時,所以細胞內(nèi)
NR的含量不僅決定于NR的合成速率,還決定于
NR的降解速率。光下NR的合成高于暗中,35S標
記的NR在暗中的降解速率快于在光下(
Weiner和
Kair,1999
)。Kair和Huber通過蛋白質(zhì)雜交技
術發(fā)現(xiàn),黑暗處理菠菜時,去磷酸化會減緩其葉片中
NR的降解。他們還發(fā)現(xiàn),NR蛋白磷酸化酶不僅控
制NR的催化活性,而且是NR降解過程中的信號,
磷酸化的NR更易被降解。后來,有人用人工手段
使黑暗處理中的葉片NR恢復活性后,發(fā)現(xiàn)NR蛋
白量處于較穩(wěn)定的狀態(tài),這表明非活性態(tài)的NR比
有活性的NR更容易被降解(
Kair等,1999
)。由
此可以推測NR降解的一個重要前提是142323s與
pNR的結(jié)合。Weiner等推測,142323s在NR的降
解過程中起到以下三點作用:
(
1
)促進NR的失活;
(
2
)阻止pNR的分裂;
(
3
)引發(fā)NR的蛋白水解。
Cotelle等(
2000
)卻發(fā)現(xiàn)在缺少糖的情況下,
Arabidopsis的細胞內(nèi)NR及其它蛋白失去了14232
3s的結(jié)合位點,如果按上述觀點,則NR實際活性會
增強,但事實與之相反,NR快速地被降解。于是推
測可能存在另一種完全不同的蛋白酶,它由于糖缺
乏而產(chǎn)生,其作用底物是未結(jié)合142323s的NR。而
在糖充分的條件下,并無上述情況發(fā)生。至今仍不
清楚細胞內(nèi)高糖含量、高NR活性狀態(tài)、高NR穩(wěn)定
性之間是相互關聯(lián)還是有因果關系。
4 結(jié)語
關于NR活性調(diào)節(jié)的研究已由過去的生理水平
逐步深入到分子水平。隨著研究的深入,人們發(fā)現(xiàn)
NR能催化數(shù)種反應。它催化NO
2
-生成的NO在
植物體內(nèi)可能起一定的信號作用,但此反應受哪些
內(nèi)外條件的調(diào)節(jié),生成的NO在植物體內(nèi)又如何起
作用,其作用是在特定條件下產(chǎn)生還是一直有產(chǎn)生,
這些將是今后研究的一個重點。另外,盡管對NR
的翻譯后調(diào)節(jié)已經(jīng)有一定程度的了解,但仍有許多
問題要解決:影響NR活性的因素是否能夠調(diào)節(jié)
NR降解酶、是否與NR的降解有直接關系,NR降
解過程中是否還有其他一些物質(zhì)起作用。影響NR
活性的因素中,光是如何起作用的,其作用是直接的
還是間接的,與糖含量有無關聯(lián)。我們發(fā)現(xiàn)干旱、氮
素濃度的高低對NR活性有著很大的影響(待發(fā))
,
這種影響是直接的還是間接的還有待進一步研究。
在NR翻譯后調(diào)節(jié)過程中,142323s本身的調(diào)節(jié)機制
與其和pNR的結(jié)合有何聯(lián)系,pNR和其他磷酸化
片段與142323s結(jié)合的競爭機制如何。重金屬離子
在NR活性調(diào)節(jié)過程中起何種作用等等。雖然仍有
很多問題需要解決,但隨著多種突變體的得到,分子
生物學技術及免疫技術的深入應用,又將使NR的
研究進入一個全新的領域。
參考文獻:
宋松泉,王永銳,傅家瑞.1993.高等植物中硝酸還原酶的
研究進展[J].作物雜志,
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4
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廣 西 植 物 24卷
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