2024年3月12日發(作者:數學周記怎么寫)

專論與綜述 中 國 釀造 2016年第35卷第12期
總第298期 ● 。 ●
環脂肽的研究進展
黎循航 ,張言周,,魏志文t,管政兵 ,蔡宇杰 ,廖祥儒
(1.江南大學工業生物技術教育部重點實驗室,江蘇無錫214122;2.江西農業大學生物科學與工程學院,江西南昌330045;
3.鹽城師范學院,江蘇鹽城224051)
摘要:脂肽主要通過微生物的非核糖體合成酶途徑合成。由于其具有廣譜抗菌活性、生物表面活性劑活性、低毒、可生物降解等多種
傭廢棄物生產日I覘 亨面綜述其研究進展。
生物學功能而引起人們廣泛的關注。環脂肽是由非極性的脂 i酸鏈結合極性的氨基酸肽鏈部分陶J茂,其中,氨基酸肽鏈自身成環或與部分
脂肪酸鏈結合成環。從環脂肽的結構、生物合成機制、合成調控、發酵方式、產量拋 翱
關鍵詞:環脂肽;非核糖體合成酶;生物合成機制;合成調控;廢棄物
中圖分類號:Q一1 文章編號:0254—5071(2016)12—0005—07 doi:10.11882/j.issn.0254—5071.2016.12.002
Recent advances in cyclic lipopeptide
LI Xunhang ,ZHANG Yanzhou。,WEI Zhiwen ,GUAN Zhengbing ,CAI Yujie ,LIAO Xiangru
f1.KeyLaboratoryofIndustrialBiotechnology,MinisOyofEducation,Jiangnan University,Wuxi214122,China;2.College ofBioscienceand
Engineenng,JiangxiAgrDulture University,Nanchang330045,China;3.Yancheng Teachers Universi ̄Yancheng224051,China)
Abstract:Lipopeptides are primarily synthesized by nonfibosomal peptide sntyhetases OqRPSs)of microorganism.Diverse functional properties such
as broad-spectrum ntiamicrobial activity,biosurfactant activity,low toxiciy tand biodegradability oflipopeptides attracted many researchers’attention.
Cyclic lipopeptides are constituted wih non-poltr faatty acid chain covalent binding to polar amino acid peptide chain,whereby,fatty acid peptide
chain covalent binding to cyclic amino acid peptide chain or participate in peptide cyclization.The research progress of lipopeptide structure,biosyn-
thetic mechanism,biosynthesis regulation,fermentation pattem,yield optimization strategy and waste utilization to produce lipopeptides were re-
viewed.
Key words:cyclic lipopeptides;nonribosomal peptide synthetases;biosynthetic mechanism;biosynthesis egrulation;waste
細菌和真菌感染是造成農作物和采收后水果蔬菜腐
敗損失的主要因素。尤其在過去的幾十年里隨著農產品
產量的增加,病蟲害導致的經濟損失越來越嚴重。為應對
越演越烈的病害,人們對農藥的需求愈加強烈。但是,大
量農藥的使用不僅導致農作物根際土壤微生物生態系統
的平衡被破壞及植物病原菌的抗藥性的產生,而且使病
蟲害的抗藥性增加,并對環境造成嚴重危害。因此,研發
更為綠色環保的防治方法來替代單一化學農藥備受
關注。
制、合成調控、發酵方式、產量優化策略及利用廢棄物生產
脂肽等方面的研究進展進行了總結。
1環脂肽結構
依據肽鏈的拓撲結構的不同,微生物所產生脂肽可以
分為環狀脂肽和線狀脂肽。環狀脂肽包括多粘菌素(poly-
myxin)、達托霉素(daptomycin)隸面活『生素(surfactin)、伊枯
草菌素(imfin)、芬薺素(fengycin)、paenibacterin和pseu—do-
factin等。
1.1 Polymyxin
此外,隨著抗生素的發現及廣泛應用,病原微生物對
常用抗生素產生耐藥性增強的現象普遍出現,如越來越
多的多重耐藥病原細菌的出現給人類健康帶來巨大的威
脅。研究發現從微生物中尋找新的抗菌物質是有效緩解
病原菌耐藥性產生的解決方案之一。
脂肽是細菌產生的具有多種生物活性物質。其中環
脂肽在抑制植物病原菌和多重耐藥病原細菌方面均展現
獨特的能力。本文對近年來環脂肽的結構、生物合成機
收稿日期:2016.09—17
一
Polymyxin是由類芽孢桿菌(Paenibacillus spp.)產生的
類陽性環狀十元脂肽,見圖1(1)。其中肽鏈部分c末端
的7個氨基酸構成環狀,另Pb3個氨基酸呈鏈狀與脂肪酸側
鏈連接【1】。Polymyxin發現于20世紀4O年代后期,起初用于
治療革蘭氏陰性細菌感染,但臨床應用發現其對人體具
有顯著的腎毒性和神經毒素危害而被限制使用。近年來,
隨著臨床多重耐藥病原菌的出現,polymyxin再次成為可
用于治療此類革蘭氏陰性病原菌的備選抗生素。其中
基金項目:無錫農業科技支撐項目(CLE01N1310);江蘇省產學研前瞻項目(BY2014023.28);江西省青年科學基金(20122BAB214027)。
作者簡介:黎循航(1978.),男,講師,博士,主要從事微生物次級代謝產物研究工作。
+通訊作者:廖祥儒(1964一),男,教授,博士,主要從事生物化學與分子生物學研究工作。
6.2。’ № 2
‘ ‘ S Ieria O N 298
.
.
Ghina Brewi
na
t ̄rewtng
Forum and Summary
polymyxin B和polymyxin E由于抗病原菌效果較強和毒副
病[3]。Daptomycin在鈣離子存在的情況下,與細菌細胞質膜
中的陰性的磷脂酰甘油發生交互作用,破壞細胞膜的完
整性,起到抗菌作用。
1.3 Paenibacterin
作用相對較低而得以臨床應用。但有臨床報道表明
polymyxin B能夠引起患者體內組胺釋放導致機體血管舒
張和血壓降低[2】。
n、R——L-Dabl——L?TbJ2——D-Dab3——L?Dab4——L-Dab5——D?LcL ̄6——L-Thr7——L-Dab8——L-Dab9——L-Tlrl0
Paenibacterin是由溶硫胺類芽孢桿菌(Paenibacillus
thiaminolyticus)OSY.SE產生帶正電荷的環狀脂肽,由13
pol3anyxm A
po1)au3xin B L-Dab3;D-Phe6;L-L Il7
個氨基酸和c15脂肪酸酰基側鏈構成,見圖l(3)。Paeni.
bacterin對包括單增李斯特菌(Listeria monocytogenes)、
L-errs.L? p7…DAlas L- p9 L-GlyL0
pol3au3"gaa E:L-Dab3:D-Leu6;L-Lea17
R 7,j6- 基辛酸或仲辛酸
2)R L-Trpl…DAsa2 L-腳3 L-Thr4…LGly5
MRSA、大腸桿菌(Es erichia coh3 O157:H7、傷寒沙門氏
doptolllyem L———————————————————一 KDI13 3ln-(Ylul2一D—s l1
R y 甓酰
(3)R Om1 Val2
R y 受酰
4、R L-Gbt I.-Ser2 L-Thr3 L-Leu4 L
psemlofnem I l——————————————————
懈endo cln【j L Lets
R 棕櫚酸側磷
CH,
5)CH -CH。(CH2) -CI4。CH2-CO L-G1uI
sxnfaotin I、:I卜7 L—L.Leu7 D.LA
sttrfa ̄tin B n=8
 ̄trfaotfil C。n=9
sxtrfaet/,1 D n=l0
6)cH ’(cH2)
。
n
0I2 。∞ L一 1 。。lr、T2 。’A蜘。 L。Gl ’4
NH I 一S 7 D’A, ̄16 L.Pro5
1tmlIlA
ba ̄illomyoin L L-Aspl L-se—L-Glu5 D?s 6 L-11Ⅱ7
baeillomyoin D.L一:k ̄ll、1.-Pro4,L-Ght5.1)?Set6.L-Thr7
baeillonnoin F L-A 1、I -Gin4.I.-Pn^D- n6 L?111|7
myoosubtilin:L- 1、L ̄ln4 L-ProS D?Set6 I.-ASh7
lPl0-13
(JH
CH -(CH 2).aJII-CPI 2"CO L-Glul D。( 2 、lT3 D’Thr4 L-Glu5
9
m A I一liel0 I -I、忡 L-(Hll8
t ̄ngycin B D-Val6
nl2.I,
圖1不同脂肽結構
Fig.1 Primary structures of lipopeptides
1.2 Daptomycin
Daptomycin是由玫瑰孢鏈霉菌解淀粉芽孢桿菌
(Streptomyces roseosporus)產生的一種酸性環脂肽,見
圖1(2)。由13個氨基酸組成,其中在Kynl3的羧基和Thr4
的羥基間形成酯鍵,構成包含l0個氨基酸的大環內酯鏈,
環Pb3個氨基酸殘基連接C 。~c。 脂肪酸酰基鏈。Dapto.
mycin對包括耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(methicillin—re.
sistant Staphylococcus aul'eus,MRSA)、耐萬古霉素腸球菌
(vancomycin.resistant Enterococci,VRE)和耐青霉素肺炎
鏈球菌(Penicillin-resistant Streptococcus pneumoniae,PRSP)
在內的革蘭氏陽性多重耐藥菌具有很好的防治效果。
2003年最先被美國食品藥品監督管理局(food and drug
administration,FDA)批準在美國上市,商品名為Cubicin,
可用于皮膚感染、心內膜炎、脊髓炎、軟組織感染、炭疽
菌(Salmonella typhi)在內的革蘭氏陽性和革蘭氏陰性細
菌具有殺菌活性 。體外試驗表明,paenibacterin所帶正電
荷能夠與大腸桿菌外膜層帶負電荷的內毒素結合,破壞
細胞膜的完整性,造成鉀離子從胞內流出[5】。
1.4 Pseudofactin
Pseudofactin II是由熒光假單孢菌(Pseudomonas lfuo.
1'escens)BD5產生的環狀脂肽,由八元肽與棕櫚酸構成,
見圖【4)。由于其脂肪酸側鏈不帶有羥基基團,相比于sur—
factin、iturin或polymyxin,pseudofacm II的抑菌活力微弱,
但能夠有效預防致病微生物在導尿管、植入體和人工血
管內粘著并抑制病原菌形成生物膜。PseudofacmII具有降
低表面張力的功能且沒有溶血活性,所以其可作為表面
涂布劑用于醫療器械[6]。此外,其能通過質膜的透化作用
對人類黑素瘤A375具有細胞毒性作用[71。
1.5 Surfactin
Surfactin是由芽孢桿菌(Bacillus)產生的具有抗生素
作用的脂肽。由7元肽和c ,~c。 脂肪酸酰基鏈組成,見
圖1(5)。Surfactin具有出色降低表面張力的能力,對G+ ̄IIG’
細菌具有拮抗作用,也具有抗病毒、抗支原體和抗腫瘤等
作用。由于其具有溶血作用,存在水解哺乳動物細胞的風
險,在醫療上的應用受到限制。攜帶C 鏈疏水性脂肪酸側
鏈的surfactin具有顯著的溶血活性嘲。GAO Z等[9】研究發現
由解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)WH1產生
的菌纖維素(fungin),屬于surfactin的類型之一,通過免疫
調節作用對小鼠模型中對1型糖尿病具有改善作用。
1.6 Iturin
Iturin是由枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)產生的環狀
脂肽,具有7元肽部分和長度為C。,~c。 的 .羥基脂肪酸
鏈,見圖1(6)。肽鏈中脂肪酸長度的改變導致iturin具有多
樣性,可分為iturin A,iturin C,iturin D,iturin E,bacil.
1omycin LcStlmycosubtilin。Iturin ̄夠生物防治多種植物病
原菌,如:Xanthomonas campestris cucurbitae,Pectobacteri-
um carotovo171m subsp.Carotovorum,Rhizoctonia solani,
Fusariumgraminearum等。
1.7 Fengycin
Fengycin是由B.subtilis或Paenibacillus產生的具有抗
專論與綜述 中 國 釀造
5
2們6
總第
3
期
2
9 8
期
?
7?
真菌作用的脂肽,由10元肽和C ~c 脂肪酸酰基鏈構成,
見圖1(7)。其能擾動細胞質膜的脂質雙分子層和在局部靜
電驅動重建 ,對絲狀真菌具有廣譜抗菌作用。相對于其
他脂肽,豐原素(fengycin)的溶菌活性較弱,所以在制藥領
域的使用有限。可成為治療皮膚真菌病(念珠菌病和皮
模塊在肽鏈延伸過程中負責特異性識別、激活并結合特
定底物。在NRPSs合成過程中,PCP結構域必須由無活性
的脫輔酶形式轉化為有活性的全酶形式。通過磷酸泛酰
巰基乙胺基轉移酶(phosphopantetheinyl trasferase,PPTase)
的催化作用,CoA的泛酰巰基乙胺基以磷酸二硫鍵連接到
癬)潛在的藥品。
2生物合成機制
對脂肽合成相關基因分析鑒定表明,脂肽是由一系
列相關基因簇共同表達調控合成。其中大多數環狀脂肽
是由非核糖體合成酶(nonfibosomal peptide synthetases,
NRPSs)催化合成。所不同的是,iturin家族脂肽由NRPSs與
聚酮合酶(polyketide synthases,PKSs)形成PKS/NRPS雜交
的生物合成的模板指導合成。
NRPSs是由多個功能化模塊組成的復合酶體系,且每
個模塊又由多個具有催化功能的結構域組成。根據組成
模塊和結構域的不同,N】 Ss能夠合成大量結構和功能具
有顯著差異的肽類物質。最基本的NRPSs由啟動模塊、核
心模塊和終止模塊3部分組成。其中主要的結構域包括腺
苷酰化(adenylation,A)結構域、縮合(condensation,C)結
構域、肽酰基載體蛋白(peptidyl carrier protein,PCP)結構
域和硫酯酶(thioesterase,TE)結構域。除此之外,許多
NRPS模塊中還包含一些其他的結構域,如羥基化(hy-
droxylation,H)結構域、糖基化(glycosylation,G)結構域、
氨基轉移酶(aminoWansferase,AMT)結構域、甲基化(methy-
lation,MT)結構域、氧化酶(oxidase,Ox)結構域、還原酶
(reductase,Re 構域、甲基轉移酶(methyltransferase,MT)
結構域、環化(cyclization,Cy)結構域、濃縮/差向異構化
(condensation/Epimerization,C/E)結構域。
NRPSs典型核心模塊的排列方式為C—A—PCP。其中A
結構域(約550個氨基酸,50 ku)負責肽鏈延伸過程中識別
特定氨酰單體;PCP結構域(約80個氨基酸,8~10 ku),具
有一個硫醇位點用于共價結合酰基肽鏈延伸過程中的底
物或中間產物。C結構域(約450個氨基酸,50ku),負責其
上下游PCP上氨酰基底物間的縮合反應。NRPSs的起始模
塊通常為A—PCP,A結構域識別肽鏈合成的第一個氨基
酸,將其共價結合 ̄IJPCP結構域上。但個別NRPss的起始
模塊由C—A.PCP組成, ̄tHplipastatin。C結構域起到將氨基
酸N末端進行酰基化作用[1l】。NRPSs的終端模塊通常由
C.A.PCP—TE組成,其中TE結構域具有水解和環化作用,
通過還原酶催化硫醇還原生產多肽前體物質。
非核糖體肽的化學合成是將一些小的構建單體通過
化學迭代縮合構成線性寡聚物。參與NI ss合成的前體不
限于20種蛋白氨基酸,其構建單元的種類超過3o0種,如非
蛋白質氨基酸、羧基酸和羥基酸等。其中一些構建單體是
由微生物產生的專一性酶催化初級代謝產物而成。每個
PCP結構域中一特定絲氨酸殘基側鏈上,形成以硫醇為末
端的泛酰巰基乙胺基結合臂。肽鏈延伸過程中,氨酰基鏈
和肽鏈共價結合在泛酰巰基乙胺基結合臂的硫醇位點。
在M 存在的條件下,A結構域識別特定氨基酸,并消耗1
個三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)活化氨基酸殘
基的羧基形成氨酰基.AMP的酸酐混合物,隨后將氨酰基
基團安裝 ̄IJPCP結構域的硫醇位點。C結構域催化上游
PCP硫醇位點的肽基與下游PCP硫醇位點的親核氨酰基
間形成C-N鍵,并將肽基基團轉移到氨酰基團,使肽鏈增
加一個氨酰殘基。
D氨基酸殘基普遍存在于脂肽的肽鏈結構中,對脂
肽生物學功能的實現起到重要作用。由于微生物細胞中
大多缺失I)-氨基酸,尤其是非蛋白質類I).氨基酸。研究表
明用于NRPSs合成的D-氨基酸主要來自兩條途徑。其一,
外部的消旋酶產生I)-氨基酸,隨后被A結構域選擇識別并
活化。其二,NRPSs模塊中包含的差向異構酶能催化氨基
酸旋光性的改變,使工廣氨基酸轉變為I)-氨基酸。在革蘭氏
陽性細菌中通常包含一個約50 l(u的差向異構酶結構域,
可對參入的厶氨基酸殘基單體進行差向異構化作用,形成
D氨基酸【 。該模塊的結構為C。A.PCP—E,其中E結構域將
工廠氨酰基底物或肽基底物轉變成D構象,并使二者濃度保
持相對平衡。在隨后的肽鍵形成過程中,比鄰E結構域下
游的c結構域特異性排斥L氨基酸,僅D氨基酸被接納參
與下游肽基合成【塒。
3環脂肽合成調控
表1 各種環脂肽合成NRPSs的基因組成
Table 1 Genetic organization of the NRPSs of diverse cyclic
lipopeptides
脂肽 NRPSs基因組成
Polymyxin pmxA、pmxB、pmxE
Daptomycin
dp 、dptBC、dptD
Corpeptin
crpC、crpD、crpE
Pelgipeptin
plpD、plpE、plpF
Surfactin srfA、srtB、srfC、srlD
Iturin
ituA、ituB、ituC、ituD
Bacillomvcin
brnyA、bmyB、bmyC、bmyD
Fengycin fcnA、fcnB、fenC、fenD、fenE
8.2們6 N。?
。 。 Seri a 0I N 298
.
.
Chi Brewi
China Brewing
Forum and Summary
脂肽的合成通常受到組成NRPSs基因表達的影響
(見表1)。調控其中各個基因的轉錄能夠有效的改變脂肽
表達量。
脂解酶,Hpc基因編碼磷酸泛酰巰基乙胺基轉移酶[19】。
3.5 Surfactin合成基因
Surfactin合成基因簇為 基因簇,其中srfA、srfB、srfC
由p刀1x基因簇編碼合成,其中pmxA、pmxB和pmxE ̄
到NRPss作用,識別特異氨基酸合成肽鏈。pmxC、 似D位
于pmx基因簇中間負責編碼腺苷三磷酸結合盒轉運蛋白
TP.binding cassette,ABC),編碼2個跨膜轉運蛋白。敲
和s舡I起到NI ss作用編碼肽鏈。在芽孢桿菌中,群體效
應對脂肽的合成起到重要作用。 ̄Isurfactin基因的表達伴
隨著菌體密度的增加,尤其在從指數生長期轉向穩定生
長期時表達量最高,而fengycin ̄litufin基因的表達出現在
除這兩基因將導致polymyxin產生量降低。etcB基因編碼
二氨基丁酸氨基轉移酶,負責polymyxin@ ̄蛋白質氨基
穩定生長期的后期。在各種脂肽中,surfactin的調控機理比
較明確。Surfactin生物合成的調控網絡包括感受態調節蛋
酸殘基2,4。二氨基丁酸(2,4一diaminobutyric acid,Dab)合
成。菌株e糾 基因缺失導致不產polymyxin。abrB基因編碼
一
種DNA結合蛋白,可結合于pmxA的啟動區域從而抑制
轉錄的發生,阻斷polymyxin的合成。spoOA基因編碼的
SpoOA蛋白能夠競爭性結合abrB基因,導致AbrB蛋白合
成受阻,從而解除其對polymyxin合成的阻遏【l4】。Yu z等【
研究發現在發酵35 h后添加脂肽結構前體氨基酸會抑制
脂肽合成相關基因的表達,從而顯著抑¥1polymyxin E的
合成。L—Dab會抑¥1pm,,A、pmxE ̄因及2,4.氨基丙酮酸氨
基轉移酶合成基因ectB基因的表達。L.Leu和D.Leu能抑
制pmxA基因表達。L Asp能抑制ectB、pmxA、pmxE基因
的表達。
3.2 Daptomycin ̄-f成基因
Daptomycin ̄dp堪因簇編碼合成,其中d口tA、dptBC
和dptD基因起到NRPSs作用。Daptomycin的13個氨基酸中
Om6、MeGlul2和Kynl3為非蛋白質氨基酸殘基。其中Om
來源于菌體的初級代謝,而不在daptomycin合成基因簇
中。dp嬉因編碼蛋白將S.腺苷甲硫氨酸(S adenosylme
thionine,SAM)的甲基轉移到 .酮戊二酸生成3.甲基僅.酮
戊二酸,進而通過轉氨反應生成甲基谷氨酸。dp蝴碼的
色氨酸.2,3.雙加氧酶催化L Trp犬鳥氨酸形成N.甲酰犬尿
氨酸,在犬尿氨酸甲酰胺酶作用下脫甲酰基形 。合
成基因簇附近的@tR2基因負責編碼DptR2調節因子。該
調節因子是非特異性調節因子,能調控daptomycin的合
成,但不調節dpc基因的表達 。
3_3 Cor1)eptin合成基因
Pseudomonas corrugata CFBP 5454合成的corpeptin為
環狀脂肽,編碼NRPSs的基因為crpC、crpD、crpE。當菌體
處于高密度時,誘發crpC基因的表達。與群體效應相關的
LuxR基因轉錄調控因子(PcoR和RfiA)對crpC基因的表達
具有積極作用【18】。
3.4 Pelgipeptin合成基因
Paenibacfflus e培 B69合成的pelgipeptin,pip基因簇負
責脂肽的合成,其中編碼NRPSs的基因為plpD、pipe、plpF。
Pelgipeptinl ̄肽的1,3,6位置含有3個非蛋白質氨基酸(L-2,
4一二氨基丁酸),I ̄plpA基因負責編碼。plpB ̄因編碼胞外
白ComA/ComP、細胞密度相關信息素ComX和磷酸酶相
關蛋 ̄tRapC。菌體生長過程中合成的信息肽ComX分泌到
胞外,當ComX達到某一濃度菌體便會誘導細胞膜上組氨
酸激酶ComP磷酸化調節子ComA,ComA.P綁定在srfA的
啟動子區域,啟動surfactin的合成。RapCt ̄夠對ComA.P去
磷酸化,從而抑¥1surfactin的合成。RapC活力取決于細胞
內五肽磷酸酶調節蛋白PhrC的濃度。低濃度Pl 導致
RapC ̄活力,進而促進sf躔因的表達,而高濃度PhrC抑制
surfactin的生物合成。細胞PhrC濃度受 ̄lSpoOK透性酶
的影響,其功能為協助PhrC透過細胞膜進行轉運。 因
的表達還受到其他轉入因子的調節,如:正調節因子 ̄DegU
蛋白和H O 脅迫響應因子PerR)和負調節因子(AbrB以及
GTP感應因子CodY)[20-2”。
3.6[turin ̄成基因
Iturin家族脂肽合成受到多種調控網絡的調控。如
Mycosubtilin的合成受到AbrB蛋白的調節。bacillomycin D
的合成受到多重調控。DegU直接激活b腳y操縱子的表達。
在bmyr ̄動子區域上游有兩個位點可以結合DegU。第一
個位點位于接近轉綠起始區域上游.123~.99 bp;第二位
點在位于上游.201~ 172 bp。第一結合位點綁定DegU能
觸發DNA鏈發生彎曲,從而使第二位點能與DegU發生有
效的結合,第二位點的結合對于bmy操縱子的啟動是必須
的。降解酶調節蛋白(DegQ)是一種多效調控蛋白,含有46
個氨基酸,調控降解酶、胞內蛋白酶及幾種胞外酶的表達。
研究表明DegQ能夠促進非核糖體途徑合成的抗生素的產
生,并有利于提高bacillomycin D的產量。與DegU作用機
制相比,DegQ采用間接調控方式促進bmy基因的表達,而
媒介蛋白為DegU。原因是:(1)DegQ與典型轉錄調節蛋白
無同源性;(2)DegQ過量表達不能彌補由于DegU缺失對
bacillomycin D合成的影響;(3)當DegQ與bmyD啟動子區
域兩個結合區域完全綁定后,DegQ對6my基因表達的調
控作用才開始顯現。DegQ與環腺苷酸蛋白激酶的小部分
區域具有同源性,可能具有促進DegU的轉磷酸化作用[221。
研究發現ComAtl夠促進degQ基因的表達,通過DegQ間
接影響bacillomycin D的生物合成吲。此外,bacillomycin D
的合成也受到細胞內膜蛋 ̄YczE的影響。當敲除解淀粉
專論與綜述 中 國 釀造 2016年第35卷第12期.9.
總第298期 一
芽孢桿菌FzB42中lyczE基因,會完全抑¥1Jbacillomycin D的
合成,而不會影響其他抗菌肽的合成 。
4環脂肽發酵方式
的合成呈正偶聯關系。
4.3無泡沫法生產脂肽
此外,一些學者嘗試建立無泡沫產生的發酵方法生
脂肽為兩性分子,發酵罐中好氧微生物分泌的脂肽
在通氣和攪拌的條件下會產生大量泡沫。泡沫順大氣壓
力降低方向運動排出罐體,造成代謝產物和料液的流失
并造成污染。為防止泡沫產生,通常在發酵過程中流加消
泡劑將泡沫抑制在合理水平。隨著脂肽不斷合成,所消耗
產脂肽類物質。 ̄oriNo A等剛利用B.subtilis以豆腐渣和
豆渣為底物進行固體發酵,surfactin最大產量為2.0 g/kg
(濕質量)。SLWINSKI C T等 利用Bacillusptunilus未
水解的豆渣和甘蔗渣質量比(1:1)為底物進行固體發酵,
甘蔗渣主要起到膨松劑的作用,其surfactin的產量達到
消泡劑的量也不斷增加。由于消泡劑的價格高,且在下游
純化工藝中難以去除,所以,消泡劑的大量使用會增加脂
肽生產成本,在規模化生產中難以實現。至今脂肽的發酵
生產規模僅限于實驗室水平。為此,許多學者采用不同發
酵方式嘗試解決泡沫帶來的問題。
4.1泡沫收集法生產脂肽
早期解決此問題的辦法是提高罐內攪拌剪切力或氣
體壓力,但二者均不能有效消除脂肽產生的泡沫。2001年,
DAVIS D A等[251提出采用泡沫溢出法回收發酵液中的所
含的表面活性產物。相對于不含菌體細胞的發酵液,含有
菌體細胞的surfactin的發酵液能更高效的產生泡沫,且泡
沫中液體的含量更多。而不含菌體細胞的surfactin發酵液
的富集比例最高可達5l,高于含有菌體細胞的發酵液,二
者的surfactin回收率均達到97%左右。在轉速為166 r/arin
的條件下,通過泡沫收集的surfactin量達到1.2 g/L。YAO
S等閉同樣采用泡沫溢出法發酵生產surfactin。研究發現,
在轉速和通氣量質量分別維持在150 r/min和1 wm的條件
下,泡沫中surfactin的質量濃度可以維持在4 g/L的水平,
最高質量濃度可以達到4.7 g/L。
4.2添加固形物生產脂肽
一
些學者研究則采用在發酵培養基中添加固形物質
提高生物表面活性劑的產量。FOX S L等 在使用B.sub.
tilisATCC 21332發酵生產surfactin時發現,以固體土豆替
代可溶性土豆汁能更有效的合成surfactin,推測固體底物
可能更適合surfactin的合成。YEH M S等例也嘗試在發酵
液中添加固體載體物質,包括:活性炭、瓊脂和膨脹黏土,
以測試這些物質對枯草芽孢桿菌產surfacfin的影響。試驗
結果證明,固型添加物能有效促進surfactin的合成,其中添
加活性炭的效果最為顯著。活性炭在發酵過程中能夠有
效提高菌體的濃度,進而提高surfactin的產量。當在發酵液
中添加25 g/L活性炭時,surfactin的產量達到3.6 g/L,而對
照的產量只有0.1 g/L。隨后,YEH M S等 結合泡沫溢出
法和添加固型載體法的特點,在發酵罐內添加活性碳,并
在發酵罐外連接泡沫收集罐,細胞回收裝置和surfactin沉
淀裝置,嘗試提高surfactin的產量。結果表明,在未添加消
泡劑的情況下,surfactin ̄夠穩定和高效的產生,產量最高
達到6.45 g 。試驗同時表明氧氣體積傳質系數與surfactin
6.5 eCkg干物質。類似固體發酵法也用于iturin的發酵生產,
iturin的產量達到14 g/kg干物質,為液體發酵產量的10倍
左右[32]。PIEDRAHITA.AGUIRRE A等[33】研究在發酵iturin
時通氣量對固體發酵過程中壓力變化、氧氣消耗、培養基
的滲透性、溫度變化造成的影響。結果表明,在通氣量為
0.4 L/min時,iturin的質量分數達到5.58 ga g干物質。
CouTTE F等 利用無泡沫生成生物反應器生產sur-
factin和fengycin。由于在氣液界面上安裝了中空纖維膜,
發酵液在發酵過程中不會產生泡沫。Surfactin產量達到
0.242 g/L,且其中的大部分吸附在中空纖維膜上。而
COI rE F等 則采用旋轉碟片生物反應器生成surfactin,
發酵過程中,菌體懸浮生長并在碟片上形成生物膜。
當碟片旋轉暴露在空氣中時,菌體能利用罐內的氧氣進
行有氧呼吸,surfactin最大產量達到0.212 。而當罐內氧
含量受限制時,菌體產生fengycin的量則會超過surfactin的
產生量。有趣的是,WILLENBACHER J等【 嘗試采用厭氧
發酵法生成surfactin。BacillU8 subtilis DSM 10T在厭氧發
酵罐中發酵,雖然surfactin最大產量只有0.087 g/L,但通過
計算以消耗葡萄糖產生surfactin的產品轉化率發現,sur-
蠡lc觚厭氧發酵的轉化率達到0.278 g/g,該數值高于大多數
通氣液體深層發酵的產品轉化率。
5產量優化策略
許多學者應用多種策略優化提高脂肽產量。如為提
高玫瑰孢鏈霉菌(Streptomyces roseosporus)產daptomycin的
水平,常用策略是采用Plackett-Burman設計、最陡爬坡試
驗、響應面設計和均勻設計等方法優化培養基組分或培
養條件[36-371。其次優化daptomycin合成前體物質癸酸的補
料起始時間、補料流加方式策略也有助于daptomycin發酵
水平的提高[38-39]。
6利用廢棄物合成環脂肽
脂肽除用于化妝品行業和醫藥行業,也可用于農業,
如:種植業和養殖業。而目前脂肽的價格偏高限制其在農
業應用范圍。在脂肽生產過程中,底物成本占據總成本的
10% ̄30%左右。而利用農業或食品行業中產生的廢棄物
生產脂肽,即可有效降低脂肽的生產成本,又可緩解廢棄
物對環境造成的危害。近年來,許多研究關注于利用農業
廢棄物稻稈和食品生產后的廢液,如玉米漿、面條生產后
?
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。恙 China Brewing
得較高的脂肽產量(見表2)。
Forum and Summary
的廢水、壓榨橄欖油后的廢棄物和長時間煎炸食物后的
食用油等生產脂肽類物質,在降低生產成本的同時,也獲
表2微生物利用不同廢棄物合成脂肽
Table 2 Lipopeptides synthesized by microorganisms with diferent waste substrates
7展望
fengycin and model bilayers quantiied by coarsfe—grained molecular
環脂肽類物質在多個領域中都表現出潛在的應用價
值,但目前產率低,生產成本高及代謝調控理論的不完善
均阻礙了脂肽的廣泛應用。未來可通過高產菌株的選育和
基因工程技術的改選使脂肽的產量達到工業化生產水平。
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