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            基于中藥整合藥理學(xué)平臺(tái)的參桃軟肝方抗癌分子機(jī)制研究

            更新時(shí)間:2023-06-02 11:40:36 閱讀: 評(píng)論:0

            ?方藥研究?
            基于中藥整合藥理學(xué)平臺(tái)的參桃軟肝方抗癌
            分子機(jī)制研究
            ?
            劉展華1,莊振杰2,林麗珠1?,黃慈輝2,孫治中2,李佳容2
            (1.廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院,廣州一510405;2.廣州中醫(yī)藥大學(xué),廣州一510405)
            一一摘要:目的:基于中藥整合藥理學(xué)平臺(tái)篩選參桃軟肝方抗癌治療的主要成分及作用靶點(diǎn),構(gòu)建相關(guān)網(wǎng)絡(luò)對(duì)參桃軟肝方的抗癌機(jī)制進(jìn)行預(yù)測(cè)分析三方法:借助中藥整合藥理學(xué)平臺(tái)及DAVID 數(shù)據(jù)庫對(duì)參桃軟肝方行整合藥理學(xué)分析,從多角度探索其抗癌機(jī)制三結(jié)果:研究結(jié)果表明,參桃軟肝方中具有抗癌作用的藥物成分種類豐富,抗癌治療的關(guān)鍵靶點(diǎn)主要包括ADORA3二RHOA 二AKT1二KRAS 三涉及的關(guān)鍵通路包括T 細(xì)胞受體信號(hào)通路二癌癥通路及趨化因子信號(hào)通路,涉及的參桃軟肝方潛在治療癌種包括結(jié)直腸癌二胰腺癌二慢性髓性白血病等三結(jié)論:參桃軟肝方具有多成分二多靶點(diǎn)干預(yù)腫瘤疾病的特點(diǎn)三本研究結(jié)果初步闡明參桃軟肝方抗癌治療的藥效成分二作用靶點(diǎn)二分子通路及潛在的治療癌種,為進(jìn)一步深入揭示其作用機(jī)制奠定了基礎(chǔ)三一一關(guān)鍵詞:參桃軟肝方;抗癌機(jī)制;腫瘤;整合
            藥理學(xué)平臺(tái)
            一一中圖分類號(hào):R289.5一一文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A一一文章編號(hào):1006-3250(2021)01-0124-07
            Molecular Anti-Cancer Mechanism Rearch on Shentao Ruangan Recipe Bad on
            Integrative Pharmacology
            LIU Zhan-hua 1,ZHUANG Zhen-jie 2,LIN Li-zhu 1?,HUANG Ci-hui 2,SUN Zhi-zhong 2,LI Jia-rong 2(1.The First Affiliated Hospital of Guangzhou University of Chine Medicine,Guangzhou University of
            Chine Medicine Guangzhou 510405,China;2.Guangzhou University of Chine Medicine,Guangzhou 510405,China)一一Abstract :Objective :To further investigate the potential molecular mechanism and active components of Shentao Ruangan recipe for treating cancer.Putative targets of Shentao Ruangan recipe were predicted and herbs-ingredients interaction network ,ingredient-targets interaction network were constructed bad on integrative pharmacology.Method :The traditional Chine medicine of Integrative pharmacology databa and DAVID databa were applied to preform integrative pharmacology analysis of Shentao Ruangan re
            cipe.The underlying mechanisms of Shentao Ruangan recipe for cancer treatment were analyd from multi-angles.Result :This study found that multiple ingredients of Shentao Ruangan recipe could exert therapeutic effect on cancer.The anti-cancer effect of Shentao Ruangan recipe was mainly associated with the hub targets including :ADORA3,RHOA ,AKT1,and KRAS.The hub pathways involved were T cell receptor signaling pathway ,pathways in cancer ,and chemokine signaling pathway.In addition ,Shentao Ruangan recipe might exert therapeutic effects on colorectal cancer ,pancreatic cancer ,chronic myeloid leukemia and other cancers.Conclusion :Shentao Ruangan recipe could treat cancer through multiple ingredients and multiple targets.The prent study preliminarily revealed the active ingredients ,hub targets ,molecular pathways and potentially curable cancer types of Shentao Ruangan recipe ,which will contribute to the further rearches of this effective formula.
            一一Key words :Shentao Ruangan recipe ;Anti-cancer mechanism ;Cancer ;Traditional Chine medicine of Integrative pharmacology (TCMIP )
            ?基金項(xiàng)目:廣東省中醫(yī)藥管理局科研項(xiàng)目(20183003)-參桃軟肝片對(duì)HBx 蛋白導(dǎo)致的肝癌DNA 甲基化狀態(tài)的影響;廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院創(chuàng)新強(qiáng)院工程項(xiàng)目(2016ZJ04)-參桃軟肝片制劑研究
            作者簡(jiǎn)介:劉展華(1965-),女,廣東潮州人,主任醫(yī)師,博士研究生,博士研究生導(dǎo)師,從事腫瘤的中西醫(yī)結(jié)合臨床與研究三
            ?通訊作者:林麗珠(1962-),女,廣東汕頭人,主任醫(yī)師,博士研究生,從事腫瘤的中西醫(yī)結(jié)合臨床與研究,Tel :86+20-39358466,E-mail :lizhulin903@139 三
            一一癌癥已經(jīng)成為嚴(yán)重影響人類生命健康的常見疾病,近年來其發(fā)病率和死亡率不斷呈現(xiàn)出上升趨勢(shì)三美國(guó)癌癥學(xué)會(huì)發(fā)布的癌癥全球流行病學(xué)報(bào)告[1]顯示,2018年全球癌癥發(fā)病例數(shù)1810萬,其中有960萬人因癌癥疾病而死亡三在中國(guó),癌癥的發(fā)病形勢(shì)同樣嚴(yán)峻三國(guó)家癌癥中心發(fā)布的‘全國(guó)癌癥統(tǒng)計(jì)報(bào)
            告2018版“[2]顯示,2014年全國(guó)惡性腫瘤估計(jì)新發(fā)病例數(shù)380.4萬例(男性211.4萬例,女性169.0萬例),平均每天超過1萬人被確診為癌癥,每分鐘有7個(gè)人被確診為癌癥,癌癥日益嚴(yán)峻的發(fā)病形勢(shì)給抗癌的治療和預(yù)防帶來了巨大的社會(huì)醫(yī)療壓力三中醫(yī)學(xué)源遠(yuǎn)流長(zhǎng),在長(zhǎng)期的防治腫瘤疾病的實(shí)踐中形成了基于中醫(yī)理論指導(dǎo)的具有鮮明特色的中醫(yī)腫瘤學(xué)科體系三中醫(yī)在預(yù)防腫瘤發(fā)生以及抗癌治療減毒增效二抗耐藥二抑制復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移等方面具有明顯優(yōu)勢(shì),已成為防治腫瘤疾病不可或缺的重要醫(yī)療措施[3]三
            參桃軟肝方是國(guó)醫(yī)大師周岱翰教授治療肝癌常用經(jīng)驗(yàn)方,主方由山慈菇二桃仁二半枝蓮二當(dāng)歸二人參二白術(shù)二甘草二仙鶴草8味藥組成三本方以 健脾祛瘀
            法 組方,針對(duì)于癌邪 虛 與 瘀 的病理特點(diǎn),功能健脾養(yǎng)肝二軟堅(jiān)消癥,其在培補(bǔ)脾氣二滋養(yǎng)肝陰的同時(shí),兼顧活血化瘀二軟堅(jiān)消癥,常用于肝癌的不同臨床階段,具有改善肝功能二緩解黃疸二腹水等臨床癥狀等療效三研究證實(shí),本方聯(lián)合肝癌的常規(guī)治療,可提高中晚期原發(fā)性肝癌患者的疾病控制率,延長(zhǎng)患者生存時(shí)間,同時(shí)保護(hù)患者肝功能,提高患者生存質(zhì)量[4]三鑒于其良好的臨床療效,目前以本方為基礎(chǔ)研制而成的參桃軟肝膠囊[5-8]二參桃軟肝丸[9-15]二參
            桃軟肝片[16-17]等口服制劑已逐漸運(yùn)用于臨床及相關(guān)研究三但參桃軟肝方抗癌分子機(jī)制尚未完全闡明,同時(shí)其治療肝癌外適應(yīng)證仍有待進(jìn)一步探索三中藥方劑治療疾病的過程中涉及多成分二多靶點(diǎn)的協(xié)同作用,單一的 藥物-靶點(diǎn)-基因 的研究模式難以對(duì)中藥方劑作用過程及機(jī)制形成系統(tǒng)正確的認(rèn)識(shí)三針對(duì)目前存在研究模式的不足,相關(guān)學(xué)者借助中醫(yī)藥大數(shù)據(jù)聯(lián)合計(jì)算機(jī)平臺(tái)提出 整合藥理學(xué) 的研究新模式三該模式立足于藥物靶點(diǎn)預(yù)測(cè)二網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及功能分析等不同分析模塊,是探索中藥方劑化學(xué)物質(zhì)實(shí)體與機(jī)體生命活動(dòng)交互規(guī)律的一種新模式[18-19]三中藥整合藥理學(xué)計(jì)算平臺(tái)( www.Tcmip/)是這一模式下的研究實(shí)踐平臺(tái),該平臺(tái)是以中醫(yī)藥大數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),以人工智能二數(shù)據(jù)建模和數(shù)據(jù)挖掘二網(wǎng)絡(luò)科學(xué)等學(xué)科方法和技術(shù)為支撐,構(gòu)建的用于中藥整合藥理學(xué)分析的計(jì)算機(jī)平臺(tái)[19]三該平臺(tái)可運(yùn)用于中藥藥效物質(zhì)基礎(chǔ)分析二中藥有效成分分子機(jī)制探討二中藥質(zhì)量控制二中藥新藥研發(fā)以及中藥臨床精準(zhǔn)用藥等方面,同時(shí)也可為揭示中醫(yī)原創(chuàng)思維的科學(xué)價(jià)值和傳承名醫(yī)經(jīng)驗(yàn)提供一定的技術(shù)支撐[20-21]三
            本研究旨在基于中藥整合藥理學(xué)計(jì)算平臺(tái)及相關(guān)數(shù)據(jù)庫,運(yùn)用整合藥理學(xué)方法對(duì)參桃軟肝方中潛在的抗癌主要成分二作用靶點(diǎn)以及信號(hào)通路進(jìn)行分析,為進(jìn)一步借助實(shí)驗(yàn)探究其確切的抗癌機(jī)制以及臨床新藥研發(fā)提供依據(jù)三
            1一數(shù)據(jù)來源與方法
            1.1一參桃軟肝方的活性成分來源
            在整合藥理學(xué)平臺(tái)(http:?ip/)的中藥成分?jǐn)?shù)據(jù)庫中,收集 山慈菇  桃仁  半枝蓮  當(dāng)歸  人參  白術(shù)  甘草  仙鶴草 8味中藥的活性成分,建立參桃軟肝方的化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫三1.2一藥物及疾病靶點(diǎn)預(yù)測(cè)與獲取
            整合藥理學(xué)平臺(tái)通過Open Babel提取參桃軟肝方藥物成分的化學(xué)分子指紋,并將其與Drug Bank 中獲FDA批準(zhǔn)的抗癌藥物指紋進(jìn)行比對(duì),平臺(tái)利用Tanimoto系數(shù)對(duì)結(jié)果進(jìn)行評(píng)分,選定評(píng)分>0.8的為相似性藥物,將相似性藥物靶點(diǎn)作為參桃軟肝方的潛在作用靶點(diǎn)[22]三以 cancer 及 tumour 為疾病關(guān)鍵字在整合藥理學(xué)平臺(tái)的疾病靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行檢索,檢索結(jié)果為治療 cancer 及 tumour 的疾病靶點(diǎn),建立癌癥靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫,將數(shù)據(jù)庫中的靶點(diǎn)結(jié)果作為參桃軟肝方的候選靶點(diǎn)來源三
            1.3一蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與分析
            整合藥理學(xué)平臺(tái)整合了In Act二DIP二MINT二HA 蛋白互相作用二OPHID二PDZBa二Reactome二HPRD 等8個(gè)現(xiàn)有蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫的信息,通過整合藥物學(xué)平臺(tái)的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),構(gòu)建參桃軟肝方藥物的潛在作用靶點(diǎn)-癌癥疾病靶點(diǎn)的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)[22]三通過整合藥理學(xué)平臺(tái)的網(wǎng)絡(luò)分析模塊蛋白互相作用網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)浞治觯?節(jié)點(diǎn)連接度 的2倍中位數(shù)為卡值,選取中藥靶點(diǎn)-疾病基因的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)(hubs);在此基礎(chǔ)上,以 節(jié)點(diǎn)連接度 (degree) 節(jié)點(diǎn)緊密度 (cloness) 節(jié)點(diǎn)介度 (betweenness)的中位數(shù)為cutoff值,選取同時(shí)滿足3個(gè)卡值的節(jié)點(diǎn)為參桃軟肝方潛在靶點(diǎn)-癌癥疾病靶點(diǎn)互作網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵靶點(diǎn)三
            1.4一基因功能和通路分析
            中藥整合藥理學(xué)平臺(tái)整合了GO(Gene Ontology)(tology)和KEEG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)(http:/ /jp/kegg)兩大基因組信息數(shù)據(jù)庫,可對(duì)篩選出的作用靶點(diǎn)直接進(jìn)行功能分析和通路富集分析三使用整合藥理學(xué)平臺(tái)中這2個(gè)模塊分別對(duì)參桃軟肝方潛在作用靶點(diǎn)二參桃軟肝方抗癌治療的關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行GO及KEGG分析[22],按P值大小分別獲取具有明確條目ID的前20個(gè)GO及KEGG分析結(jié)果三
            1.5一共同關(guān)鍵靶點(diǎn)通路分析
            將獲取的參桃軟肝方與癌癥疾病共同靶點(diǎn),使用DAVID數(shù)據(jù)庫(Version6.8https:?david. v/)[23]
            進(jìn)行KEGG通路分析,將獲得結(jié)果中P值有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的前20個(gè)通路與參桃軟肝方抗癌治療的關(guān)鍵靶點(diǎn)KEGG通路分析結(jié)果進(jìn)行匹配,并使用R軟件(version3.5.1)繪制維恩圖三2一結(jié)果
            2.1一參桃軟肝方化學(xué)成分靶標(biāo)預(yù)測(cè)及分析
            通過對(duì)參桃軟肝方成分靶點(diǎn)預(yù)測(cè)及分析,共收集參桃軟肝方化學(xué)成分437個(gè),其中白術(shù)成分32個(gè),其主要成分為多糖二白術(shù)三醇等;半枝蓮8個(gè),其主要成分為內(nèi)脂類二黃芩苷等;當(dāng)歸65個(gè),其主要成分為多糖二阿魏酸等;甘草133個(gè),人參158個(gè),其主要成分為人參皂苷二人參多糖等;桃仁3個(gè),其主要成分為苦杏仁甙二糖類等;仙鶴草22個(gè),主要成分為三萜及其苷類二黃酮類化合物;山慈菇16個(gè),其主要成分為糖苷類化合物及萜類化合物等三收集藥物靶點(diǎn)共計(jì)3236個(gè),其中山慈菇108個(gè),桃仁35個(gè),半枝蓮62個(gè),當(dāng)歸370個(gè),人參2013個(gè),白術(shù)210個(gè),甘草360個(gè),仙鶴草78個(gè)三
            表1二2示,對(duì)參桃軟肝方潛在靶點(diǎn)進(jìn)行GO分析,結(jié)果顯示潛在靶點(diǎn)基因涉及的生物學(xué)功能包括細(xì)胞溶質(zhì)二外泌體二ATP結(jié)合二線粒體基質(zhì)二線粒體電子轉(zhuǎn)運(yùn)等條目,根據(jù)P值大小排序,篩選具有明確ID的條目共計(jì)20條三KEGG通路富集結(jié)果顯示,參桃軟肝方潛在靶點(diǎn)作用的通路條目包括氧化磷酸化二碳代謝二糖酵解和糖質(zhì)生成等,其涉及病種包括阿爾茲海默病二帕金森病二非酒精性脂肪性肝病等三根據(jù)P值大小排序,篩選具有明確ID的條目共計(jì)13條三
            表1一參桃軟肝方潛在靶點(diǎn)具有的功能信息
            條目ID條目名稱富集基因數(shù)目P值GO:0005829cytosol391  4.31E-102 GO:0005515protein binding603  4.00E-79 GO:0005524ATP binding212  3.25E-63 GO:0006468protein phosphorylation1058.42E-50 GO:0004672protein kina activity69  1.77E-45 GO:0019899enzyme binding81  2.80E-42 GO:0043066negative regulation of apoptotic process95  4.23E-42 GO:0019901protein kina binding889.96E-42 GO:0007165signal transduction148  1.02E-41 GO:0042493respon to drug80  3.09E-40 GO:0005654nucleoplasm247  1.68E-37 GO:0004674protein rine/threonine kina activity76  3.98E-35 GO:0005737cytoplasm353  6.92E-34 GO:0008284positive regulation of cell proliferation867.04E-34 GO:0004713protein tyrosine kina activity46  1.07E-32 GO:0046777protein autophosphorylation53  1.37E-32 GO:0005739mitochondrion146  1.39E-32 GO:0042802identical protein binding98  1.54E-32 GO:0018105peptidyl-rine phosphorylation45  6.87E-32 GO:0018108peptidyl-tyrosine phosphorylation50  1.83E-31
            表2一參桃軟肝方潛在靶點(diǎn)參與的通路信息
            條目ID條目名稱富集基因數(shù)目P值hsa05010Alzheimer's dia66  3.25E-31 hsa05012Parkinson's dia60  2.68E-30 hsa04932Non-alcoholic fatty liver dia(NAFLD)61  1.11E-29 hsa00190Oxidative phosphorylation56  2.08E-28 hsa05016Huntington's dia62  3.54E-25 hsa01
            200Carbon metabolism47  3.71E-25 hsa00010Glycolysis/Gluconeogenesis34  4.01E-21 hsa00640Propanoate metabolism247.59E-21 hsa00620Pyruvate metabolism27  1.72E-20 hsa00280Valine,leucine and isoleucine degradation27  1.03E-19 hsa00020Citrate cycle(TCA cycle)227.65E-19 hsa00330Arginine and proline metabolism27  2.41E-15 hsa04724Glutamatergic synap38  3.15E-15
            圖1一參桃軟肝方抗腫瘤的關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)注:RS代表人參,GC代表甘草,TR代表桃仁, BZL代表半枝蓮,XHC代表仙鶴草
            圖2一參桃軟肝方藥物-成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)
            一一2.2一參桃軟肝方抗腫瘤的關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
            圖1二2表3示,經(jīng)過整合藥理學(xué)平臺(tái)的篩選,得到參桃軟肝方及 cancer  & tumor  關(guān)鍵靶點(diǎn)共計(jì)780個(gè),其中藥物直接作用靶點(diǎn)152個(gè),已知疾病靶點(diǎn)268個(gè),藥物與疾病共同靶點(diǎn)29個(gè),其他靶點(diǎn)331個(gè)三將以上靶點(diǎn)匯總并構(gòu)建 參桃軟肝方潛在作用靶點(diǎn)腫瘤疾病靶點(diǎn) 的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)三蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中,根據(jù)節(jié)點(diǎn)連接度僅顯示前100個(gè)靶點(diǎn),連接度越大說明節(jié)點(diǎn)越大三通過該網(wǎng)絡(luò)共確定參桃軟肝方與癌癥共同靶點(diǎn)5個(gè),分別為ADORA3(Adenosine receptor A3)二RHOA (Transforming protein
            RhoA )二AKT1(RAC-alpha rine )二KRAS (KRAS proto-oncogene )二GMPS (Guanine monophosphate syntha )三將參桃軟肝方中靶點(diǎn)為包含上述5個(gè)靶點(diǎn)藥物及其成分進(jìn)行確認(rèn)并進(jìn)行數(shù)據(jù)整理,使用Cytoscape 軟件(version 3.7)構(gòu)建藥物-成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖,其中參桃軟肝方中有上述關(guān)鍵靶點(diǎn)且存在作用關(guān)系的成分?jǐn)?shù)量為322個(gè),通過該網(wǎng)絡(luò)體現(xiàn)了參桃軟肝方多成分-多靶點(diǎn)的藥物作用關(guān)系,表明參桃軟肝方可通過多成分二多靶點(diǎn)治療癌癥疾病三參桃軟肝方中與上述5個(gè)靶點(diǎn)均存在相互作用關(guān)系的藥物成分及數(shù)量二主要藥物成分分類三
            表3一參桃軟肝方中與關(guān)鍵靶點(diǎn)有相互作用的成分及藥物分類比較
            藥物名稱藥物成分總數(shù)
            與SADORA3/RHOA /AKT1/KRAS /GMPS 存在均存在相互作用關(guān)系的藥物成分?jǐn)?shù)量
            相關(guān)作用關(guān)系的主要藥物成分人參2013155人參皂苷二人參醇白術(shù)3211白術(shù)內(nèi)酯二蒼術(shù)酮桃仁33兒茶素二苦杏仁苷二蟲草素仙鶴草2222仙鶴草酚二仙鶴草內(nèi)酯山慈菇162秋水仙堿二反式甲酰胺半枝蓮84苦丁素二黃芩苷甘草133125甘草素二甘草皂苷當(dāng)歸
            65
            注:條形圖中按-log10(P.value )值大小顏色從紅色向紫色漸變,-log10(P.value )值越大則P 值越小,條目相關(guān)性越強(qiáng)
            圖3一參桃軟肝方抗腫瘤關(guān)鍵靶點(diǎn)具有功能信息
            一一BZ 代表白術(shù),SCG 代表山慈菇,藍(lán)色節(jié)點(diǎn)代表藥物,綠色節(jié)點(diǎn)代表成分,紅色節(jié)點(diǎn)代表關(guān)鍵靶點(diǎn)三
            2.3一參桃軟肝方化學(xué)成分靶標(biāo)預(yù)測(cè)及分析圖3二4示,參桃軟肝方抗癌關(guān)鍵靶點(diǎn)的GO 功能分析顯示,參桃軟肝方藥物靶點(diǎn)與疾病關(guān)鍵靶點(diǎn)基因功能涉及蛋白結(jié)合二細(xì)胞質(zhì)二核原生質(zhì)二ATP 結(jié)合二信號(hào)傳導(dǎo)二蛋白質(zhì)磷酸化多個(gè)條目,根據(jù)P 值大小進(jìn)行排序,篩選具有明確ID 的條目共計(jì)20條三通過整合藥理學(xué)平臺(tái)進(jìn)行參桃軟肝方靶點(diǎn)通
            路富集分析顯示,參桃軟肝方抗癌關(guān)鍵靶點(diǎn)主要涉及的通路有T 細(xì)胞信號(hào)通路二ERBB 信號(hào)通路二FoxO 信號(hào)通路二趨化因子信號(hào)通路二細(xì)胞凋亡等,涉及病種為乙型肝炎二慢性髓性白血病二結(jié)直腸癌二前列腺癌二胰腺癌等三根據(jù)P 值大小,篩選出具有明確ID 的條目共計(jì)14條三結(jié)果提示,參桃軟肝方的抗癌關(guān)鍵靶點(diǎn)在上述信號(hào)通路及病種中具有重要作用三
            2.4一共同靶點(diǎn)分析
            表4圖5示,將參桃軟肝方關(guān)鍵抗癌靶點(diǎn)ADORA3二RHOA二AKT1二KRAS及GMPS使用DAVID數(shù)據(jù)庫(Version6.8https:?ifcrf. gov/)進(jìn)行基因注釋三其中ADORA3二RHOA二AKT1二KRAS4個(gè)基因呈現(xiàn)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的注釋結(jié)果,將其所涉及的通路按P值大小選取前20個(gè)條目,將所得條目與參桃軟肝方抗癌關(guān)鍵靶點(diǎn)所涉及的通路進(jìn)行匹配,并使用R軟件繪制維恩圖,最終得到3條共同通路及2個(gè)涉及的共同病種三3條通路分別為T細(xì)胞受體信號(hào)通路(T cell receptor signaling pathway)二癌癥通路(Pathways in cancer)和趨化因子信號(hào)通路(Chemokine signaling pathway),2個(gè)共同癌種為胰腺癌(Pancreatic cancer)和結(jié)直腸癌(Colorectal cancer)三結(jié)果表明,上述涉及的基因二通路及病種在參桃軟肝方抗癌治療中具有重要的作用,值得在今后的研究中進(jìn)行深入探索
            注:氣泡圖中氣泡按P值大小二顏色從綠色向紅色漸變,點(diǎn)的大小與富集的基因數(shù)量成正比
            圖4一參桃軟肝方抗腫瘤關(guān)鍵靶點(diǎn)所參與的通路信息
            表4一參桃軟肝方抗癌治療關(guān)鍵靶點(diǎn)的KEGG分析
            ID條目名稱Gene Proportion Bar Gene Count P-value hsa04071Sphingolipid signaling pathway4  4.9E-4 hsa05210Colorectal
            cancer3  1.1E-2 hsa04660T cell receptor signaling
            pathway3  1.9E-2 hsa04722Neurotrophin signaling
            pathway3  2.1E-2 hsa04022cGMP-PKG signaling
            pathway3  2.9E-2 hsa04062Chemokine signaling
            pathway3  3.3E-2 hsa05205Proteoglycans in
            cancer3  3.3E-2 hsa04015Rap1signaling
            pathway3  3.2E-2 hsa04014Ras signaling
            pathway3  3.2E-2 hsa01521Pathways in
            cancer38.5E-2 hsa05213Endometrial
            cancer2  1.8E-1 hsa05223Non-small cell lung
            cancer2  1.7E-1 hsa05221Acute myeloid
            leukemia2  1.7E-1 hsa04370VEGF signaling
            pathway2  1.8E-1 hsa05230Central carbon metabolism in
            cancer2  1.7E-1 hsa05212Pancreatic
            cancer2  1.6E-1 hsa05214
            Glioma2  1.6E-1 hsa05211Renal cell
            carcinoma2  1.6E-1 hsa04664Fc epsilon RI signaling
            pathway2  1.5E-1 hsa04662B cell receptor signaling
            pathway2  1.5E-1一一3一討論
            本研究基于整合藥理學(xué)方法對(duì)參桃軟肝方抗癌
            治療的有效成分二關(guān)鍵靶點(diǎn)二涉及通路及潛在治療癌
            種進(jìn)行分析,研究結(jié)果表明參桃軟肝方在治療癌癥
            方面具有多成分二多靶點(diǎn)的協(xié)同作用特點(diǎn)三參桃軟
            肝方是腫瘤名醫(yī)周岱翰教授的經(jīng)驗(yàn)方,方中人參為
            君藥大補(bǔ)元?dú)猓a(bǔ)脾益肺;白術(shù)能健脾益氣;桃仁善
            泄血滯二祛瘀力強(qiáng),可治療血閉癥瘤等多種瘀血阻滯
            圖5一共同靶點(diǎn)涉及通路與關(guān)鍵靶點(diǎn)涉及通路維恩圖
            的病證;當(dāng)歸可活血通經(jīng),當(dāng)歸二人參合用可補(bǔ)氣生

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