差分電荷密度matlab,CASTEP差分電荷密度操作流程
原標(biāo)題：CASTEP 差分電荷密度操作流程
本?例以 CO 吸附在 Pt(111) 表?上為例
1、對吸附的結(jié)構(gòu)進?結(jié)構(gòu)優(yōu)化，如圖1所?：
圖1 「優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)」
2、如果要研究吸附分? CO 和表? Pt 的之間由于吸附引起的電荷轉(zhuǎn)移，則要選中 CO 分?并定義 Set 。
【操作】：主標(biāo)題欄 Edit-Edit ts ，在 Define New Set 對話框的 Name 參數(shù)設(shè)置處，輸?的 t 名稱要包含 DensityDifference 字段，如圖2所?：
圖2 「定義 t 」
包含 t 的結(jié)構(gòu)如圖3所?：
圖3 「定義 t 的結(jié)構(gòu)」
3、提交計算任務(wù)
【操作】：Task 中選擇 Energy ，Properties 中選擇Electron density difference ，如圖4所?，提交計算。
圖4 「參數(shù)設(shè)置」
圖4中的參數(shù)說明：
Atomic densities ：軟件將計算當(dāng)前結(jié)構(gòu)中的狀態(tài)中的每個原?與其孤?存在時的電?密度差異。
Sets of atoms ：軟件將計算各個t在當(dāng)前結(jié)構(gòu)中與t包含的分?孤?狀態(tài)時的電?密度差異。
4、分析差分電荷密度
使? CASTEP ?帶的分析?具分析差分電荷密度，如圖5所?。選擇 Electron density difference ，當(dāng)直接點擊 import 時，引?基于t 的差分電荷密度。當(dāng)勾選 U atomic densities 時，引?基于 atom 的差分電荷密度。
圖5 「 CASTEP 分析?板」
使?如下?具條調(diào)整差分電荷密度的顯?。
其中 Volumetric Selection 選項，可呈現(xiàn)結(jié)構(gòu)中包含了哪類差分電荷密度。
通過?具條中的 Color Maps 調(diào)節(jié)差分電荷密度的顯?
調(diào)整前的結(jié)構(gòu)如圖6所?：
圖6 「調(diào)整前的結(jié)構(gòu)和參數(shù)設(shè)置?板」
調(diào)整后的顯?如圖7所?：
圖7 「差分電荷密度」
從差分電荷密度圖的計算結(jié)果可以看出，C原?和與C原?結(jié)合的Pt原?失去了電?，周圍差分電荷密度顯?為藍(lán)?(藍(lán)?對應(yīng)負(fù)值，失去電?)，O原?得到了電?(紅?對應(yīng)正值，得到電?)。
圖7的顯?對應(yīng)的 Color Maps 對話框的參數(shù)設(shè)置如圖8所?。不顯?的?段是通過?標(biāo)點選/劃選刪除的，這些?段對應(yīng)的是差分電荷密度接近0的區(qū)域。
圖8 「圖7顯?所需的參數(shù)設(shè)置」返回搜狐，查看更多
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