具有黃嘌呤氧化酶抑制活性的小分子肽及其應(yīng)用的制作方法
1.本發(fā)明涉及具有黃嘌呤氧化酶抑制活性的小分子肽及其應(yīng)用,屬于生物活性肽技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
2.高尿酸血癥是由嘌呤代謝紊亂引起的一種常見代謝疾病,以血清尿酸水平升高為特征。過高的尿酸水平可導(dǎo)致關(guān)節(jié)炎和痛風(fēng),甚至導(dǎo)致心血管疾病、高血壓和ⅱ型糖尿病等。尿酸的產(chǎn)生和代謝是一個復(fù)雜的過程,參與嘌呤代謝的酶可以調(diào)節(jié)體內(nèi)尿酸的產(chǎn)生,尿酸轉(zhuǎn)運體調(diào)節(jié)尿酸的排泄和再吸收。黃嘌呤氧化酶(xo)是嘌呤分解代謝的關(guān)鍵酶,它催化次黃嘌呤生成黃嘌呤,然后生成尿酸,同時過高的xo水平也會導(dǎo)致尿酸在體內(nèi)沉積,xo抑制劑可阻斷尿酸的生物合成。因此xo是高尿酸血癥的重要靶點。
3.近年來,各種合成的xo抑制劑如別嘌呤醇、非布索坦等被開發(fā)出來用于臨床高尿酸血癥。雖然合成的xo抑制劑作為抗高尿酸血癥藥物非常有效,但它們不可避免地會引起各種不良副作用,如過敏反應(yīng)和血壓升高,甚至心血管疾病和慢性腎臟疾病等。因此,迫切需要探索或開發(fā)具有較少不良副作用的xo抑制劑。
4.近幾十年來,多肽由于其易吸收、無毒、高特異性和多種生物活性等特點引起了廣泛的關(guān)注。越來越多的生物活性肽,如ace抑制肽和抗菌肽等從水產(chǎn)品中獲得,然而從水產(chǎn)品中獲取xo抑制肽的研究卻較少。此外,傳統(tǒng)的xo抑制肽純化方法主要包括凝膠過濾、離子交換、反相高效液相譜等,耗時長且純化過程繁瑣,因此迫切需要一種更加簡便可行的篩選xo抑制肽的研究方法。隨著科學(xué)技術(shù)不斷進(jìn)步,結(jié)合高性能計算機(jī)輔助設(shè)計篩選活性肽的研究逐漸發(fā)展,比如利用分子對接技術(shù)不僅能減少篩選強(qiáng)度、降低篩選周期,還能提高篩選成功的概率。但是利用計算機(jī)模擬蛋白質(zhì)酶解卻受限于蛋白序列的長度,不適用于序列較大的蛋白質(zhì)酶解,這大大降低了篩選xo抑制肽的效率。因此,酶解與分子對接相結(jié)合可能是一種替代傳統(tǒng)酶解篩選xo抑制肽更可行、更有效的方法。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
5.針對上述現(xiàn)有技術(shù),本發(fā)明提供了6種具有黃嘌呤氧化酶抑制活性的小分子肽,及其應(yīng)用。本發(fā)明主要是利用分子對接技術(shù)對蝦酶解產(chǎn)物中xo抑制肽進(jìn)行篩選,并通過分子對接闡明其高xo抑制活性的作用位點,確定其半抑制濃度。
6.本發(fā)明是通過以下技術(shù)方案實現(xiàn)的:具有黃嘌呤氧化酶抑制活性的小分子肽,為以下6種,氨基酸序列分別為:aeaqmwr,如seq id no.1所示;efgmggw,如seq id no.2所示;agginlar,如seq id no.3所示;mafgdkf,如seq id no.4所示;rwpgdmdr,如seq id no.5所示;
fnhhmf,如seq id no.6所示。
7.上述6種小分子肽,在作為或制備黃嘌呤氧化酶抑制劑中的應(yīng)用;在作為或制備具有抑制尿酸水平功效的藥物中的應(yīng)用。
8.本發(fā)明通過實驗研究,從南美白對蝦的酶解液(胃蛋白酶、胰蛋白酶、α-糜蛋白酶)中篩選得到了6種具有黃嘌呤氧化酶抑制活性的小分子肽,這些小分子肽具有作為黃嘌呤氧化酶抑制劑、抑制尿酸水平的功能性產(chǎn)品的潛力,可用于制備具有抑制尿酸水平功效的藥物。其中aeaqmwr、efgmggw及agginlar表現(xiàn)出更高的xo抑制活性,其預(yù)防高尿酸血癥的潛在價值可能更大。本發(fā)明是對傳統(tǒng)復(fù)雜的xo抑制肽篩選方法的革新,采用了傳統(tǒng)酶解鑒定+分子對接相結(jié)合的篩選方法,提高了xo抑制肽的篩選工作效率。
9.本發(fā)明使用的各種術(shù)語和短語具有本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的一般含義。
附圖說明
10.圖1:南美白對蝦酶解液中xo抑制肽的分離純化,其中,圖1:酶解液及超濾分離酶解液得到的不同分子量組分的xo抑制活性示意圖。
11.圖2:采用sephadex g-15凝膠層析柱純化組分b(得到5個洗脫峰)示意圖。
12.圖3:葡聚糖凝膠柱純化后得到的各組分(組分b1、b2、b3、b4、b5)的xo抑制活性示意圖。
13.圖4:b-3組分的lc
??
ms/ms圖譜。
14.圖5:3種多肽的分子對接結(jié)果示意圖,其中,a-c:3種多肽aeaqmwr、efgmggw及agginlar分別與xo的分子對接結(jié)果,綠代表hydrogen bond;淺藍(lán)代表carbon hydrogen bond;橙代表attractive charge、pi-cation和salt-bridge;紅代表unfavorable donor-donor;粉代表alkyl and pi-alkyl;玫瑰紅代表pi-pi stacked。
具體實施方式
15.下面結(jié)合實施例對本發(fā)明作進(jìn)一步的說明。然而,本發(fā)明的范圍并不限于下述實施例。本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠理解,在不背離本發(fā)明的精神和范圍的前提下,可以對本發(fā)明進(jìn)行各種變化和修飾。
16.下述實施例中所涉及的儀器、試劑、材料,若無特別說明,均為現(xiàn)有技術(shù)中已有的常規(guī)儀器、試劑、材料,可通過正規(guī)商業(yè)途徑獲得。下述實施例中所涉及的實驗方法、檢測方法等,若無特別說明,均為現(xiàn)有技術(shù)中已有的常規(guī)實驗方法、檢測方法。
17.實施例1 南美白對蝦的模擬胃腸道消化將南美白對蝦的蝦肉切碎后按1:9(w/v,g/ml)的比例與水混合,調(diào)整其ph至3.0。加入1.5%(w/w)的胃蛋白酶,37℃震蕩反應(yīng)4 h;然后調(diào)節(jié)酶解液ph至6.5,加入胰蛋白酶和α-糜蛋白酶,添加量均為1%(w/w),37℃繼續(xù)反應(yīng)1.5 h;煮沸滅酶10 min,得到酶解液,凍干保存。
18.實施例2 采用高效液相譜法驗證活性肽的體外xo抑制活性取樣品或100 mmol/l pbs緩沖液(ph 7.4),加入終濃度為0.7 mmol/l的黃嘌呤和0.15 u/ml的xo,37℃孵育15 min,加入1 mol/l鹽酸終止反應(yīng)。
19.譜柱為 agilent xdb c 18(250 mm
×
4.6 mm,5μm),流動相為85%的10 mmol/l
水溶液和15%甲醇,流速為1.0 ml/min。
20.最終混合物中尿酸的含量由290 nm處的吸光度測定。酶促反應(yīng)中xo抑制活性計算為:[(空白尿酸含量
?
樣品尿酸含量)/空白尿酸含量]
×
100%。
[0021]
實施例3 南美白對蝦酶解液的超濾分離及活性測定通過兩種分子量分別為10 kda和5 kda的超濾膜分離酶解液,收集不同分子量的組分測定其xo抑制活性,結(jié)果如圖1所示。酶解液(組分a)被超濾為三個組分(組分b、c、d),其中,組分b(《5 kda)具有較高的xo抑制活性(50.46
±
0.68%,ic
50
=19.82
±
0.27 mg/ml),高于組分c(5~10 kda)和組分d(10 kda)。
[0022]
實施例4 葡聚糖凝膠過濾層析及其組分活性分析葡聚糖凝膠g-15加入適量超純水煮沸2 h,除去浮沫及雜質(zhì);再加入超純水?dāng)嚢琛㈧o置。除去上層雜質(zhì),重復(fù)以上操作直至上層無雜質(zhì)。吸掉凝膠上層多余的水,將填料以玻璃棒引流至16 mm
×
80 cm層析柱,避免分層和氣泡出現(xiàn),柱子填好后用純水沖洗,直至層析柱高度不再發(fā)生變化。
[0023]
以實施例3中測定得到的組分b作為樣品進(jìn)行上樣。上樣濃度及體積為:50 mg/ml,5 ml;收集出峰的組分(流動相為超純水,洗脫速度為2 ml/min),凍干測定不同組分的活性。
[0024]
酶解液經(jīng)凝膠譜柱的分離結(jié)果如圖2所示,依次收集洗脫峰b1~b5,凍干后復(fù)配成多肽溶液,測定各組分的xo抑制率,結(jié)果如圖3所示。洗脫峰b-3所對應(yīng)的洗脫液的抑制率最高,因此選擇洗脫峰b-3所對應(yīng)的洗脫液進(jìn)行下一步的實驗。
[0025]
實施例5 b-3組分肽段組成的lc-ms/ms質(zhì)譜鑒定(1)多肽提取b-3組分肽段脫鹽后真空干燥,以0.1%三氟乙酸溶液復(fù)溶,測定肽段濃度,以備lc-ms分析。
[0026]
(2)lc-ms/ms分析采用easy-nlc 1200系統(tǒng)(thermo fisher scientific)和 q-exactive hf-x質(zhì)譜(thermo scientific)進(jìn)行多肽檢測。多肽被裝入內(nèi)部填充的c 18毛細(xì)管捕集柱(100μm
×
20 mm, 5μm)中,并用 c 18分離柱(75μm
×
150 mm,3μm)分離。a流動相為0.1%甲酸(v/v)水溶液,b流動相為含0.1%甲酸(v/v)和 80%乙腈(v/v)的水溶液。梯度為:2%~5% b流動相0~2 min,5%~28% b流動相2~44 min,28%~40% b流動相44~51 min,40%~100% b流動相51~53 min,b流動相保持100% 53~60 min。掃描范圍設(shè)置為300~1800 m/z,初級ms分辨率為60000@m/z 200,agc目標(biāo)為3e6,一級最大it為50 ms。二次ms分辨率為15000@ m/z 200,agc靶為1e5,二次最大it為50 ms,ms2激活類型為hcd,隔離窗口為1.6 m/z,歸一化碰撞能量為28。利用質(zhì)譜檢測的原始文件,用maxquant1.6.1.0 檢索uniprot protein database,最終得到150個蛋白組和585個肽段。樣品質(zhì)譜basepeak圖如圖4所示。
[0027]
實施例6 肽段篩選、合成及驗證(1)配體的處理采用chem3d pro 14 .0軟件繪制多肽的分子結(jié)構(gòu)式,保存為mo12文件。
[0028]
(2)對受體處理從pdb數(shù)據(jù)庫中下載xo的晶體結(jié)構(gòu)1n5x,采用discovery studio(ds)2019軟件的
cdocker將1n5x中的b鏈刪除,并抽離配體非布索坦(tei)保存?zhèn)溆谩?br>[0029]
(3)分子對接使用discoverystudio(ds)2019軟件的cdocker模塊進(jìn)行分子對接。對接坐標(biāo)為x=96.6635,y=54.963,z=39.4334,對接半徑為15
?
。其他參數(shù)保持默認(rèn)值。對于每個配體,使用ds2019軟件生成10個最佳位姿,通過-cdockerenergy、-cdockerinteractionenergy的數(shù)值確定其結(jié)合程度,篩選出能量值最高的15種多肽,合成驗證其xo抑制活性,結(jié)果如表1所示。
[0030]
表1篩選的多肽信息
注:
①
由于分子對接結(jié)果具有隨機(jī)性,表中顯示的得分為10個最佳位姿的平均值;
②
多肽的毒性通過http://crdd.osdd.net/raghava//toxinpred/計算;
③“?”
表示未檢出活性。
[0031]
(4)多肽合成及活性驗證表1中具有xo抑制活性的6個肽段,均由生工生物工程(上海)股份有限公司采用fmoc固相合成方法合成。多肽活性驗證參照實施例2中的方法。
[0032]
如表1所示,6個肽段均具有xo抑制活性,其中,aeaqmwr,efgmggw及agginlar表現(xiàn)出更高的xo抑制活性,所以決定對這3種多肽進(jìn)一步進(jìn)行活性位點分析。
[0033]
分子對接結(jié)果表明(圖5),傳統(tǒng)氫鍵作用、相互吸引電荷作用和鹽橋作用在xo抑制肽與xo的關(guān)鍵殘基glu802、glu1261和arg880的相互作用中起重要作用。此外,多肽aeaqmwr的活性高于其他肽,這可能和aeaqmwr與xo中的關(guān)鍵金屬原子mos3004連接有關(guān)。
[0034]
給本領(lǐng)域技術(shù)人員提供上述實施例,以完全公開和描述如何實施和使用所主張的實施方案,而不是用于限制本文公開的范圍。對于本領(lǐng)域技術(shù)人員而言顯而易見的修飾將在所附權(quán)利要求的范圍內(nèi)。
